DNA甲基化研究案例(二)

一、调控通路

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在正常细胞中,为了维持平衡,KIF14基因启动子的DNA是以甲基化状态存在;当细胞发生癌变时,转录因子SP1和YY1结合到KIF14基因启动子上促使DNA去甲基化从而促进KIF14的表达。另外,本文还简单的表明了miR-382抑制KIF14的表达。

二、实验流程

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作者首先通过荧光素酶活性实验说明了转录因子SP1、YY1的KIF14启动子活性的影响,然后建立SP1和YY1敲低细胞株检测KIF14的表达;为了进一步验证SP1、YY1与KIF14启动子的关系,作者先用CHIP实验验证了SP1、YY1与启动子的结合,然后通过甲基化PCR实验说明SP1和YY1促使KIF14启动子的DNA去甲基化;最后作者通过检测KIF14高表达/低表达细胞中microRNA的表达和microRNA敲低后的KIF14 Mrna的表达简单的说明miR-382抑制KIF14 mRNA的表达。

三、核心FIGURE

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Figure1说明的是转录因子SP1和YY1与KIF14启动子互作影响该基因的表达。

A、 启动子荧光素酶活性实验,表明转录因子SP1和YY1影响KIF14启动子活性。

B、 Qpcr检测转录因子SP1和YY1敲低后KIF14 mRNA的表达,表明SP1和YY1敲低后KIF14 mRNA水平下降。

C、 WB检测转录因子SP1和YY1敲低后KIF14蛋白的表达,明SP1和YY1敲低后KIF14蛋白水平下降。

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Figure2说明的是转录因子SP1和YY1结合到KIF14启动子上促进DNA去甲基化。

A、 ChIP实验,分别用转录因子蛋白SP1和YY1抗体钓取结合的DNA片段,然后进行Q-PCR检测,结果表明肿瘤细胞的SP1和YY1与KIF14启动子高度结合。

B、 甲基化分析,用甲基化特异引物进行q-PCR检测正常细胞和肿瘤细胞的KIF14启动子DNA甲基化情况,结果表明肿瘤细胞去甲基化程度上升。

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Figure3说明的是miR-382抑制KIF14的表达。

A、Q-PCR检测KIF14高表达和低表达细胞的microRNA,筛选出几个差异表达的microRNA。

B、通过对micro的抑制检测KIF14 mRNA的表达情况,结果表明miR-382受抑制后KIF14 mRNA表达上升,说明miR-382可抑制KIF14的表达。

Brigitte L.The ´riault,Halesha D.Basavarajappa, Harvey Lim,et al.Transcriptional and Epigenetic Regulation of KIF14 Overexpression in Ovarian Cancer[J].PLoS ONE,2014,9(3):e91540.

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