Live OR Death?| 又是一堆小更新

写在前面

生信软件无外乎两种:活着的 和 死了的。毫不夸张,绝大多数生信软件被发表的时间点就是他一生的高光时刻。因为很快,就没人管了。想想还是可怜。
而 TBtools 不是,TBtools 目前仍然是 活着 的软件。这几天在挖数据的时候,用起来总觉得哪里不爽。于是对一些功能进行了细调,对一些功能代码直接重构(换句话说...技术债,慢慢还)。
更新内容比较多,不过可以拿出来说的可能就两三点。

热图图例优化

常常,TBtools 的老用户一看到一些发表文章的热图就可以判断出是否是TBtools出的。原因很简单:

  1. 图例的文本是深灰色,而不是常见的黑色

  2. 图例没有刻度

具体见

当然,另外配色就不提了。对应图例,可能就不再能成为辨识点,因为我修改了...总的来说,深灰色的图例和没有刻度的图例,确实缺了点东西。于是现在的图例是

当然,我还优化了横向的图例

BLAST Alignment Show

Emmm... 这是非常老的一个功能。那会可能我才加入 bioinformatics*中国。大体用处就是看看两条序列具体比对效果如何(重在覆盖率)。比如

事实上,可能没太多人知道。TBtools 中有一些图片仍然用的是 JJplot2 绘制,因为我确实有点懒。这个图则是其中一个。尽管看起来丑陋,但却有两三个人过来与我提及,他们很喜欢这个功能,也觉得图片还不错。
多少,我自己用着还是觉得不爽。主要原因还是简单:

  1. 图片确实丑

  2. JJplot2 出的图片,整体缩放不尽人意

于是呢,我重新用 JIGplot 画了一下,可以得到

多少看起来,还是好看了许多。当然,不止于此。JIGplot 自然是支持交互了。

当然,支持 核酸 蛋白... 只要是blast比对结果就可以用...

写在后面

Emmm....到点睡觉了。

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