Environmental Microbiology | 近岸到近海沿海断面的微生物群落主要由距离和温度决定
推荐：江舜尧
编译：罗睺
编辑：十九
美国杜克大学海洋实验室Dana E. Hunt等人于2019年7月9日在Environmental Microbiology发表题目为《Microbial communities across nearshore to offshore coastal transects are primarily shaped by distance and temperature》的文章。沿海地区是最具生产力的海洋生态系统之一，但由于复杂的空间和时间模式，它们往往被排除在生物化学地球模型之外。但这项研究提供了新的见解，为了更好地了解沿海海洋微生物群落的多样性和动态，我们从卡罗来纳州海岸到马尾藻海边缘的地表水横断面多次采样。重点研究沿海海洋中化学、物理和生物梯度的微生物群落转变。
文章摘要
最近的研究集中在海洋微生物群落与环境的联系，然而，对从近岸到公海的复杂梯度微生物群落模式的驱动因素研究甚少。在此，我们从皮弗岛海岸观测站（PICO）时间序列点开始，在大陆的87公里范围内，对15个站的微生物驱动因素进行了研究，穿越大陆架到达营养贫乏的水域马尾藻海。16S rRNA基因文库揭示了不同的采样位点具有很强的聚类性（近岸、大陆架和近海海洋群落）。水温和离海岸的距离(作为生产力、陆地输入和营养成分等因素的梯度的代表)都是影响群落组成的最主要因素。然而，在系统型水平上，模型显示了一些类群的分布与温度有关，另一些与离岸距离有关，还有一些与这两个因素有关，突出了具有不同环境偏好的分类群是站点明显聚类的基础。因此，大陆边缘包含微生物群落与近岸、近海环境不同，并包含具有近岸或近海偏好的系统型混合物，而不是大陆架上特有的环境。
文章中重要图片说明
图1 | 皮弗岛海岸观测站 - 纵向海洋学变化实验（PICO-LOVE）横断面（2014年7月至2016年4月）。横断面开始于纽波特河河口与博福特入口相邻（A站; PICO时间系列现场采样站）并沿对角线向外延伸至大陆架断裂边缘（E站），站点相距约21.8公里，最远的车站E距离海岸87公里。插图面板上的线条显示海洋测深。
图2 | 皮弗岛海岸观测站 - 纵向海洋学变化实验（PICO-LOVE）横断面59个月/季度样本
16S rRNA基因库的Shannon多样性，A站在大陆架间隙离E站最近。
图3 | 基于Bray Curtis的16S rRNA基因文库的非度量多维尺度排序。每个点对应于一个样本，用不同的形状和颜色表示站点。椭圆表示TH的95%置信区间。 e每个站点的平均数。与群落变异显著相关的环境变量由向量表示(通过约束排序中的排列测试评估；p<0.05)。
图4 | (A)热图显示100个最丰富的97%识别16S rRNA操作分类单元(OTUS)。跨站点的OTUS模式是通过使用树状图的相似性来排序的。(B)用线性判别分析(LDA)效果大小确定的指标OTUS所有样本(红色：近岸；绿色：大陆架；靛蓝：近海)。(C)OTUS通过GJAM(广义联合属性建模)对图S12中环境预测因子的响应进行聚类。
你可能还喜欢