生信文献速递|WGCNA发文so easy
欢迎来到医科研，这里是白介素2的读书笔记，跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘，R语言，TCGA、GEO, SEER数据挖掘。
生信文献速递|WGCNA发文so easy
作者：白介素2
文章全篇应用生物信息分析，发表文章在 Bioscience Reports杂志上，不过看起来文章实在有些匆促，不小心发现自己连自己的单位都写错了 Lanzphou University???，最近生信人的小编说： 灌水也需认真啊 。
摘要
这种文献看起来很快，关键词 GEO数据集， WGCNA分析，然后功能富集分析找 Hub gene一套操作下来说自己找到了重要的基因，然后后面不用看，就讨论基因的重要性，实在不行就验证一下。
看图说话
样本聚类热图展示
模块性状相关性热图展示
Hub gene生存分析
简单验证
TCGA数据库验证表达，再加一个ROC曲线,CCLE数据库分析基因表达。
题外话
全文就到此结束了，思路非常简单；笔者想说的是，不要觉得这些分析结果看起来很简单，我说起来也很简单；其实要完成整篇文章的数据分析，图表准备，论文撰写，投稿等过程其实非常繁琐、复杂；需要耗费作者很多心血，在这样的过程中作者会得到一个完整的训练，从这一点上来讲，我尊重每一份努力和付出。
做这样的工作，其实我们都是被拘去做的；我只是希望，如果可能的话，我们尽可能的学习、思考、进步；不顾一切的灌水我不能赞同。
附上文献链接：Co-expression of key gene modules and pathways of human breast cancer cell lines(https://doi.org/10.1042/BSR20181925)
今天的内容就到这里，我是老朋友白介素2，下期再见。
本期内容就到这里，我是白介素2，下期再见，点击下方框框留言。
赞 (0)