TCGA miRNA数据挖掘文献分享

这篇文章的题目是：Seven protective miRNA signatures for prognosis of cervical cancer

论文摘要：

宫颈癌是20多岁和30多岁女性癌症死亡的第二个原因，但对其预后的研究却很有限。本研究旨在鉴定与预后相关的miRNA并研究其功能。宫颈癌患者的TCGA数据用于建立具有单一临床参数或miRNA表达水平的单变量Cox模型。使用临床信息和miRNA表达水平构建多变量Cox模型。最后，STRING被用于丰富基因本体或途径，用于显着miRNA的验证目标，并可视化他们之间的互动。使用单变量Cox模型与临床参数，我们发现两个临床参数，烟草使用和临床阶段，和七个miRNA与生存状态高度相关。仅使用miRNA特征的表达水平，该模型可以成功地将患者分为高风险和低风险组。基于两个临床参数和七个miRNA提出了最佳特征选择模型。这七种miRNA的功能分析显示它们与癌症相关的各种途径相关，包括MAPK，VEGF和P53途径。这些结果有助于确定靶向治疗靶点的研究，这可能有助于为宫颈癌患者量身定制治疗方案。

作者的主要工作：

1、筛选与预后相关的临床参数

2、建立单因素的Cox回归模型

3、建立多因素的Cox回归模型

4、进行靶基因预测

5、对靶基因进行GO富集分析

6、对靶基因进行KEGG富集分析

7、对靶基因进行PPI分析