流式实验中的坑,我都帮你踩过了-第四坑
病例介绍
样本为培养的细胞系,洗涤后作为阴性细胞上机检测,该实验选择CytoFLEX流式细胞仪,分析软件为CytExpert。在实际检测过程中,发现认为是完全阴性的细胞群体在FITC,PE,PC5.5等通道上出现阴性和阳性的分群,而且荧光信号随着时间发生偏移。
小贝问诊答疑
虽然是培养的细胞系,培养的细胞出现污染、细胞自身表达荧光蛋白基因、药物处理后都可能出现某通道上有阳性表达。
策略:更换一批新细胞上机检测,且确认上述过程无污染、细胞不带荧光基因、不经过药物处理。然而该现象依旧存在,排除细胞问题。
分析过程中把碎片或其他噪音信号引入,在荧光通道上把噪音信号当作阴性细胞,阴性细胞当成阳性。
策略:检查分析流程,碎片信号和细胞信号区分明显,荧光通道上散点图的阴性不是由噪音信号产生,如下图。排除分析问题。
仪器硬件问题,这次意外都发生在仪器的蓝激光检测的通道,初步怀疑蓝激光或检测光路出现问题导致一系列事故发生。
策略:选择质控微球,进行仪器质控,并在该方案下检测微球信号,观察质控微球随时间变化情况。仪器质控正常,而且方案中的质控微球在time参数图中信号稳定,未出现漂移现象,如下图。所以排除仪器问题。
某蓝激光激发染料污染管道,在上样管道有非常大的残留,可对上样的阴性细胞进行染色。
策略:检查荧光通道的time参数图,如下图,随着时间增加荧光信号逐渐增加,慢慢达到信号高值保持不变,如下图,类似配体-受体结合的时间曲线,污染的可能性增大。同时咨询仪器最近使用情况,近期有进行PI染色的细胞周期实验,基本确定是PI污染。
小贝处方
PI染料虽然用着方便、简单、便宜,但可能给管路清洗带来很大麻烦。另外,不仅仅是PI,其他如7-AAD等核酸染料均存在黏附液流管路的风险。出现这种情况我们需要加大管路冲洗或更换上样系统。
清洗方式选择Beckman Coulter的CLENZ清洗液清洗一段时间,然后更换蒸馏水清洗,时间越长越好,直到清洗干净为止。如果一种方法无法满足,可以使用DNA溶液清洗管路,如鲑鱼精DNA溶液或者放置很长时间的外周血样本,由于细胞基本都碎了,白细胞释放出大量DNA。
如果上样清洗不能清洗干净,有条件可将上样针、蠕动管拆卸下来进行注射冲洗。清洗干净或更换干净的上样管路,重新进行细胞上样,结果恢复正常,如下图。
思维发散区
提问:流式检测中,常常用PI试剂排除死细胞,避免死细胞引起的偏差,但PI不适合用于固定的细胞,那有没有一种染料适合固定的样本排除死细胞,它的原理是什么?
大家可以根据自己所学流式知识思考一下,欢迎大家填表问答,我们将送出“磁性计时器“,答案下期公布。