流式实验中的坑,我都帮你踩过了-第四坑

病例介绍

样本为培养的细胞系,洗涤后作为阴性细胞上机检测,该实验选择CytoFLEX流式细胞仪,分析软件为CytExpert。在实际检测过程中,发现认为是完全阴性的细胞群体在FITC,PE,PC5.5等通道上出现阴性和阳性的分群,而且荧光信号随着时间发生偏移。

小贝问诊答疑

虽然是培养的细胞系,培养的细胞出现污染、细胞自身表达荧光蛋白基因、药物处理后都可能出现某通道上有阳性表达。

策略:更换一批新细胞上机检测,且确认上述过程无污染、细胞不带荧光基因、不经过药物处理。然而该现象依旧存在,排除细胞问题。

分析过程中把碎片或其他噪音信号引入,在荧光通道上把噪音信号当作阴性细胞,阴性细胞当成阳性。

策略:检查分析流程,碎片信号和细胞信号区分明显,荧光通道上散点图的阴性不是由噪音信号产生,如下图。排除分析问题。

仪器硬件问题,这次意外都发生在仪器的蓝激光检测的通道,初步怀疑蓝激光或检测光路出现问题导致一系列事故发生。

策略:选择质控微球,进行仪器质控,并在该方案下检测微球信号,观察质控微球随时间变化情况。仪器质控正常,而且方案中的质控微球在time参数图中信号稳定,未出现漂移现象,如下图。所以排除仪器问题。

某蓝激光激发染料污染管道,在上样管道有非常大的残留,可对上样的阴性细胞进行染色。

策略:检查荧光通道的time参数图,如下图,随着时间增加荧光信号逐渐增加,慢慢达到信号高值保持不变,如下图,类似配体-受体结合的时间曲线,污染的可能性增大。同时咨询仪器最近使用情况,近期有进行PI染色的细胞周期实验,基本确定是PI污染。

小贝处方

PI染料虽然用着方便、简单、便宜,但可能给管路清洗带来很大麻烦。另外,不仅仅是PI,其他如7-AAD等核酸染料均存在黏附液流管路的风险。出现这种情况我们需要加大管路冲洗或更换上样系统。

清洗方式选择Beckman Coulter的CLENZ清洗液清洗一段时间,然后更换蒸馏水清洗,时间越长越好,直到清洗干净为止。如果一种方法无法满足,可以使用DNA溶液清洗管路,如鲑鱼精DNA溶液或者放置很长时间的外周血样本,由于细胞基本都碎了,白细胞释放出大量DNA。

如果上样清洗不能清洗干净,有条件可将上样针、蠕动管拆卸下来进行注射冲洗。清洗干净或更换干净的上样管路,重新进行细胞上样,结果恢复正常,如下图。

思维发散区

提问:流式检测中,常常用PI试剂排除死细胞,避免死细胞引起的偏差,但PI不适合用于固定的细胞,那有没有一种染料适合固定的样本排除死细胞,它的原理是什么?

大家可以根据自己所学流式知识思考一下,欢迎大家填表问答,我们将送出“磁性计时器“,答案下期公布。

(0)

相关推荐

  • 样本制备完成了,可流式细胞术语还没搞清楚?

    流式细胞术( Flow cytometry, FCM)是一种可以对细胞或亚细胞结构进行快速测量的新型分析技术和分选技术.与一般的技术相比,流式细胞仪分析时会涉及到各种参数,对于刚入门的我们,常常搞得焦 ...

  • 流式细胞仪荧光补偿调节方法

    荧光补偿是指修正荧光光学信号在探测器之间相互渗漏并被数字化检测的过程.自单激光双色分析出现后,此过程变得十分重要.每种荧光素分子都具有自身的光谱发射范围.这些发射光谱之间存在相互叠加,在某些情况下此现 ...

  • siRNA对照解析

    A.普通阴性对照   1.siRNA实验应该有阴性对照: 2.通用阴性对照为与目的基因的序列无同源性的普通阴性对照: 3.Scrambled阴性对照和选中的siRNA序列有相同的组成,但是和mRNA没 ...

  • 细胞周期实验检测方法

    流式细胞术是一种对液流中排成单列的细胞或其它生物微粒(如微球, 细菌, 小型模式生物等) 逐个进行快速定量分析和分选的技术,经单克隆荧光抗体或者核酸特异性染料对细胞进行染色后,通过FCM可以分析细胞的 ...

  • Cell reports | 【肿瘤异质性】:“荧光生物传感器 代谢组学 活体成像”以单细胞分辨率描...

    导读 背景:肿瘤内异质性为我们对癌症生物学和癌症治疗的理解提出了挑战.肿瘤内异质性可以体现在许多水平上,包括基因组中的突变和结构变化,染色质修饰的表观遗传变异以及局部环境.肿瘤内的不同癌细胞可以以不同 ...

  • 细胞周期的概念及示意图

    细胞从前一次分裂结束起到下一次分裂结束为止的活动过程,称为细胞周期,通常由G0/G1期.S期.G2期和M期组成. ① G1期(gap1),指从有丝分裂完成到期DNA复制之前的间隙时间 ② S期(syn ...

  • 流式实验中的坑,我都帮你踩过了—第一坑

    案例介绍 客户样本细胞采用病毒转染,其中病毒有GFP荧光,检测时发现阳性比例62.61%,而荧光显微镜下则是满视野的带绿光细胞,而且荧光非常强,但流式图中显示的GFP+细胞比例似乎不够,同时荧光并非特 ...

  • 流式实验中的坑,我都帮你踩过了-第二坑

    病例介绍 CytoFlex 2L6C的仪器,客户反馈做小鼠脾脏细胞检测,预实验发现PE和PC5通道的补偿怎么也调节不好.当把PE,PC5通道单染管按顺序调节成"横平竖直"了,回头发 ...

  • 流式实验中的坑,我都帮你踩过了-第三坑

    病例介绍 Annexin V和PI双染法研究细胞凋亡是经典的流式实验之一,磷脂酰丝氨酸(phosphotidylserine, PS)在正常细胞中存在细胞膜内侧,在细胞凋亡早期磷脂酰丝氨酸从细胞膜内侧 ...

  • 避坑指南:每年买手帐本时的坑我都帮你踩过了

    避坑指南:每年买手帐本时的坑我都帮你踩过了

  • 知乎好物避坑指南:这些坑我都帮你踩过了!!

    饮冰 读完需要 5 分钟 速读仅需 3 分钟 大家好,我是饮冰. 关于知乎好物,前面介绍了知乎的创作分体系.盐值体系,以及新手如何养号等基础问题,详见下列文章: 门槛:知乎好物申请条件,创作者等级介绍 ...

  • 流式细胞技术中的APC,pure 标记是什么意思呢?

    荧光物质通常是指那些在受到一个波长激发后,处于一个能量不稳定的状态,能发射一个波长比激发波长长的光的一类物质.当然荧光并不都是受激发后发射的,如一些生物可以发射荧光,如荧火虫,发光细菌等,他们发出的光 ...

  • 干货|做流式实验,这几个关键点需要注意!

    流式细胞实验技术作为当代最先进的细胞定量分析技术之一,结合高特异性单克隆抗体,为生命科学基础研究和医疗带来了许多具有重大意义的突破,该技术也成为了生命科学和医学科研工作者极为青睐的一种分析手段,越来越 ...

  • 鸿蒙OS环境搭建的坑,我都帮你踩过了

    鸿蒙OS环境搭建的坑,我都帮你踩过了