幸而识君,不虚此行
真情实感流露最是动人,前面我们精选了20多位学员的心得体会(部分节选目录如下):
这样的分享形式已经成为了咱们学习班亮丽的风景线,本月继续!
——生信技能树马拉松课程心得
认识生信技能树和Jimmy老师的过程还是蛮曲折有趣的,现在线上的马拉松课程已经结业,Jimmy老师问有没有学习体会,我的内心就只有两个词——“值得”、“幸运”,并以此记录希望能与更多朋友们共勉。
1. 值得
因为研究课题的需要,我是一个完全湿实验的研究工作者,并专注在免疫学和肿瘤学领域长达数年。但随着研究工作的深入以及课题组逐渐的前进,我发现完全的湿实验已经无法满足现有高分文章的需求,而对数据挖掘和生物信息学技能的需求则是与日俱增,现在的科学发展已经逐渐脱离了单纯实验性的结论,大数据的支持将是锦上添花。
第一堂开课前Jimmy老师就说,生信技能树的老师们就是在各种试错和总结的基础上,用自己的教课方法,带领大家入门生信。可能其他同学们对此没什么特殊感受,但我真的深有体会。而我在参加了马拉松课程给与了“值得”一词,也是经过了多个机构的比较而下的定义。之前其他机构的课程让我的感受就是一锤子买卖,而从生信技能树的课程里我感受到每一个老师的认真和仔细,即使是课后自己复习遇到问题在群里发问,总有老师无私地解答,不知道比其他机构的所谓答疑用心多少倍。从R语言充满活力的小洁老师,到Linux课程细致入微的卖萌哥,然后再到转录组分析的娟娟老师,都非常用心地线上授课。每天晚上3小时跟直播的我们学习辛苦,但是讲课的老师更辛苦,口干舌燥,虽然我们这批学员在钉钉群可能没那么活跃,但我们真的是有在默默地认真学习哦!
下面针对3部分课程说点小心得:
R语言课程:小洁老师让我从对R语言的惧怕进化到了对R语言的掌握,当自己完成了GSE数据集的分析并作出了PPT作业的时候,我都要为自己鼓掌,却也是非常感激教课的老师。老师们承受了太多无知的问题了哈哈。也许完成GSE数据集分析这点知识在前辈老师们看起来非常简单,但对我这个几度想放弃接触生信的人来说不亚于一次重重的嘉奖,这说明教课方法非常行之有效,经过了实践的检验!
Linux基础:以前提起Linux,我的心里就是“天啊这是啥?”然而,在卖萌哥老师的淳淳教导之下,我们从最开始的一句pwd命令学习到后面应用在转录组的上游分析,在前辈老师的带领下一步一步走的扎实。这每一步我走下来都觉得受益匪浅,觉得心里不慌,觉得很稳。
转录组分析:转录组分析的应用是最常规但是又是最基本的生信分析的应用实践了,虽然很多新的测序在不断涌现,但bulk-RNA sequence的分析经常用于结合多组学的分析。娟娟老师非常仔细地带领我们从Linux下载数据开始,结合R语言进行了完整的分析。其实很多其他所谓的速成机构,3000+的费用在1-2天全天课程里也是教转录组的分析,但Jimmy老师的马拉松课程却安排很智慧,因为学到这部分的时候,因为自己前两周打下了坚实R语言基础和Linux基础,才会对这里的每一步从数据清洗到差异分析到富集分析都能掌握,而不是copy了代码却什么都不知道。学习如逆水行舟,不进则退。不积跬步无以至千里。
2. 幸运
其实去年和前年我已经意识到数据挖掘逐渐成为趋势的这个问题,也参加过2次别的机构的转录组分析流程培训+单细胞分析流程培训,也花了不少经费。不吹不黑,那些课程的确也有内容,能有一些代码,但培训结束后自己依旧云里雾里,无法独立承担起一个项目的分析和运行,而换成其他数据却也不知道替换什么参数。我也跟Jimmy老师吐槽过,为什么自己都认真参加过其他机构2次周末全天的课程依然无法融会贯通和掌握?是不是自己真的不适合生物信息分析,我准备放弃了。但是Jimmy老师还是通过自己的方式鼓励我,让我再继续尝试一次,跟着他们的马拉松课程,不要这么快对自己失望。
另外,Jimmy老师团队的格局很大,从R语言课程,老师们就非常欢迎我们自己做课下笔记,并写在我们自己的语雀或公众号里分享出来,而且B站也有Jimmy老师团队巨多的资源可以学习,也非常欢迎我们转发和宣传。生信的知识海洋太浩瀚了,而解决同一个问题的代码会有很多种写法,参数的设置也有非常多的选择。我也尝试过通过网上各种资料和视频进行自我学习,但是非常困难。但像Jimmy老师说的,自学当然可以,只不过是一段蜿蜒的路,最终可以到达终点,就是慢一点。而参与课程却能让我们避开错误的小路,提取直达目标的捷径。我跟着一个完整的团队学习,能够领悟这个团队的代码特色,不会再因为纷乱的资料而眼花缭乱。即使后续学有余力,我就有能力去糙取精,看到其他人的代码知道哪些是主干,哪些是不必要的,哪些对我有用,而哪些是没用的。并且,加入Jimmy老师学习者的圈子能够看见前辈们每周都有新的学习内容,都会复现高分文章的思路,Jimmy老师也非常谦虚地会和我们湿实验工作者探讨课题,从我们的研究角度出发出谋划策。
3. 最后
有时候命运真是神奇的事情,虽然Jimmy老师团队已经在生信普及的领域赫赫有名,但我却还是耽误了许久学习的机会,可能那时候还没意识到生信和数据挖掘的重要性。而如今,我却很神奇且很幸运地跟着学完了马拉松课程。看着微信群里有深夜还在努力学习的同学说:这数据挖掘生信分析可能是他未来3年主要的方向。我想着这位同学可能是在读研究生,在探寻自己未来的课题方向,那我觉得他太幸运了,能这么早就结识Jimmy老师和他的团队课程。所以,假设有人需要学习生信但仍在犹豫,我认为技能树是最适合开始的课程。我也希望Jimmy老师团队的“树”越来越壮大,甚至奢望有一天也能成为贡献一份力量的其中一片叶子,替一大部分科研者遮风挡雨、出谋划策。
此处不得不借最近大火的《觉醒年代》里毛爷爷的一句话与大家共勉:
在这个浮躁的时代,只有自律的人,才有可能脱颖而出,成就大事。
最后的最后在这里给自己立一个flag,完成如下所示的单细胞转录组数据的降维聚类分群(GSE139829)
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