如何拿到目前人类研究过的肿瘤基因列表

大家自己的课题如果聚焦到了某些基因，通常是想看看它们是否是肿瘤相关基因，比如肿瘤驱动基因，抑癌基因等等，这里主要是：oncoKB和CCG的list

OncoKB Cancer Gene List OncoKB Cancer Gene List Cancer Gene List. 1039 genes

CG是一个肿瘤驱动基因的数据库，目前最新版本为v6.0, 网址如下

http://ncg.kcl.ac.uk/index.php

共收录了2372个驱动基因，分成以下两个部分

  1. 711 Known cancer genes

  2. 1661 Candidate cancer genes

对于每个基因，提供了多种注释信息

抑癌基因tumor suppressor gene，简称TSG,是一类存在于正常细胞内，可以抑制细胞生长并且具有潜在抑癌作用的基因。TSGene是一个从文献中收集整理的抑癌基因数据库，文章发表在Nucleic Acids Research，链接如下

https://academic.oup.com/nar/article/41/D1/D970/1074154

数据库的网址如下

https://bioinfo.uth.edu/TSGene/

最新版本为v2.0版本，共收录了1217个human TSGs, 其中包含1018个蛋白编码基因和199个lncRNA，同时对这些基因进行了多种注释，包括表达量，突变位点，蛋白相互作用等注释信息。

写在最后

因为这个学员问题比较简单，没有资格列入我的TCGA 28篇教程，所以大家就随意看看哈！

知识点会在不久的将来更新到B站：
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