染色质免疫沉淀

染色质免疫沉淀

染色质免疫沉淀(英语:Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)被用来研究细胞内DNA与蛋白质相互作用,具体来说就是确定特定蛋白(如转录因子)是否结合特定基因组区域(如启动子或其它DNA结合位点)——可能定义顺反组。

基本内容

ChIP还被用来确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点(即组蛋白修饰酶的靶标)。 此方法的简要过程是:细胞裂解液里的蛋白和相关染色质暂时结合;染色质(DNA)-蛋白复合物被剪切,与所研究蛋白相关的DNA片断被选择性免疫沉淀;相关DNA片断被纯化,顺序被测定。一般认为这些DNA顺序在活体内与所研究蛋白结合。

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