几年过去了,现在这种简单而又烂大街的生信SCI还有期刊接收

几年前,这种下载GEO数据~差异分析~功能分析(GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析)~筛选hub基因~hub基因进行生存分析的生信发文套路非常火爆,文章相对比较好发。不过好景不长,这种文章现在非常难发了(并不代表不能发,数据结果漂亮的仍然有期刊会接收),因为这种套路实在太简单,基本上接触过生信数据挖掘的人都掌握了,除了那些还没有接触过生信的人。不过,2020年12月11日有期刊出版了这种文章,该期刊就是:Medicine,影响因子:1.552江湖所称的“四大神刊”之一发文量惊人有些单位已经将该期刊列入黑名单

文章题目:Screening and identification of key genes between liver hepatocellular carcinoma (LIHC) and cholangiocarcinoma (CHOL) by bioinformatic analysis

分析思路:

1、从GEO数据库搜索相关数据,一共找到三套数据,分别下载整理进行差异分析

2、对三套数据分析得到的差异基因取交集,一共得到170个差异基因

3、将上述得到的170个差异基因进行GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析

4、筛选出10个hub基因

5、利用GEPIA数据库验证这10个hub基因的表达水平,并且进行生存分析,发现具有预后价值的只有APOA2和ITIH2这两个基因

根据上面的分析内容,的确是操作比较简单,一个比较熟练的人估计30分钟到一个小时内就可以完成上面这些分析内容,大概2-3天就可以把文章搞出来。也许会有人说:“这种文章就是用来灌水的,像这种期刊都进了黑名单,发来能有什么用处,还好意思发的”。上面的说法的确有一定的道理,但是要分开讨论

对于国内名列前茅的大型三甲医院和名校,估计发种期刊并没有什么用,因为都进了黑名单;但是对于一些普通医院和高校,像发表这种期刊人家就可以用来毕业,用来评职称。单位不同,科研经费等资源就不同,所发表文章的质量自然不同,不能一概而论。起码这篇文章作者所在单位应该是承认这个期刊的,要是不承认估计作者也不会发表,毕竟还要给版面费的。

其实上面这篇文章还是有很大的提升空间。如果你有科研经费,可以对APOA2和ITIH2进行相关实验验证,也可以尝试探索作用机理。如果你没有科研经费也没有关系,我们可以利用TCGA数据库的数据进行验证,并且可以结合临床数据构建模型等一系列分析,也可以结合免疫评分等热点进行分析

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