《基因组学》课程-学习笔记之一

写在前面

分子生物学相关知识的学习，可能一直停留在大三阶段。那会看完了几本书，自我认为目前为止，可以满足与多数人的日常交流。然而，一方面当时是囫囵吞枣，不甚了解；另一方面，时间过去太久，年龄也不小了，一直用不上的部分，早已忘却（多数知识点，在讨论学术问题时，完全用不上）。
约莫是那个时候，我发现了很多优质的网络公开课，上研究生之后，就也基本没看。往往是时间问题，所以我对高铁这个过程，又爱又恨。
漫长的车程，让人难受；而事实上，也只有在这个短暂的时间，才能静下心学习。看看一些网络课程，在火车上，比看书简单得多，至少，摇晃也没有感觉，而且不用翻书。
最近坐高铁多了，一直在看复旦大学-杨金水老师的《基因组学》这门课程，感觉挺不错。
做一些小的笔记。

一些截图与个人笔记

基因组测序的常见路线。虽然现在一上来就是三代，HiC，光学图谱，不过分析逻辑并没有大的变化。

目前我们课题组在做一个物种的基因组，总的来说...感觉杂合度更高....

群体多态性组成频率 PIC。主要是记录概念，0.25

PIC的计算公式 与 实例

这个图是乱入的，在社交网站上看到的，感觉不错，可以帮助一些人搞清楚一些概念。

常染色质，异染色质... 基因密度。

真核生物的三种RNA聚合酶（植物的有Pol IV...) 不同的聚合酶负责不同的基因转录。5.8S 和 5S 是不同聚合酶转录的产物

28S 18S 5.8S 成簇分布 并 形成 重复的单元。

tRNA的启动子在基因的内部

增强子的效率 与 增强子 和 启动子 之间距离 是否是 整倍数 相关。

转录前起始复合物和延伸复合物
在转录开始后，转录起始复合物多数仍然保留并等待下一个延伸复合物。

测序深度在10x以上，然而看我们手上的数据...嗯，还是至少30x 50x吧

原来内含子剪切除了 GT-AG之外，还存在其他的特点....

hypothetical...其实就是纯粹的 基于文本的预测。

2011年，做个BinGO发个Nature....

写在最后

很多时候，你的落后是注定的；也是无关紧要的。生活是否快乐，或许只是你是否愿意接受现状而已。