3分+零代码单基因生信+验证，投稿到接收2个月+数据库使用教学
今天给大家介绍一篇去年11月刚刚online的单基因单基因生信+验证。8月份投稿，10月份接收，11月online，又是人生赢家。对于单基因的分析，挑选基因最为关键。小编认为容易发表的基因要符合以下几点（符合条件越多越好）：
1 在多种肿瘤中该基因高表达
2 在多种肿瘤中该基因高表达的患者预后差
3 在多种肿瘤中该基因在高分期表达较高
4 不同肿瘤中的富集分析有比较集中的几种结果
5 在一种或者多种肿瘤中与特定免疫细胞浸润相关，如巨噬细胞，CD8T细胞等
6 最好用不同的方法证明5中的结论
7 在某一种或者几种肿瘤中集中于一些免疫相关基因相关性高
8 该基因最好报道过，但是又研究较少，有一定新颖性
如果能筛选到这样的基因，再添加单基因的各种层面分析，肯定是比较容易接收的。能再加一些实验验证就更好不过了。新的一年，赶紧把文章投了吧。
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另外本文所有数据库恰好我们公众号以前都介绍过
那么我们来看这篇文章符合以上哪些条件
文章名：Pan-cancer analysis identifies ESM1 as a novel oncogene for esophageal cancer
影响因子：3.13，即时影响因子：3.79.
我们首先检索一下这个基因在肿瘤中的研究,只有9篇肿瘤相关文章，非常符合条件8
Figure 1
GEPIA 数据库分析该基因在泛癌中的表达
Figure 2
Ualcan数据库分析该基因在泛癌中的表达
Figure 3
StarBase数据库分析该基因在泛癌中的表达
Figure 4
该基因在GEPIA数据库中的总生存预后分析
Figure 5
该基因在LinkedOmics 数据库中的总生存预后分析
Figure 6
该基因在GEPIA数据库中的DFS预后分析
Figure 7
前面几个figure结果的交集
Figure 8
该基因的分期表达以及表达验证
Figure 9
该基因的富集分析，增殖侵袭实验
Figure 10
该基因的细胞周期和凋亡
Figure 11
探索该基因影响增值侵袭的机制，跑了个明星通路的分子
这篇文章单看生信方面其实分析的很一般，竟然同样是TCGA数据，用不同数据库的结果来凑数。单看实验方面，也很一般，表达增殖侵袭，加上明星分子的表达。但是合在一起也可以发三四分，博士毕业都没问题。我觉得今年发纯生信希望还比较大。到明年了纯生信肯定不好发，这样做也是很好的。这也就是单基因分析的优势。要是你做的是预后模型。实验要怎么补？单基因的话就没有这种烦恼。