肿瘤表观遗传的好用数据库,快来看看吧
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CR的高通量可视化数据库
染色质调节因子(chromatin regulators,CR)可以动态调节染色质结构,以表观遗传方式调节基因表达,从而对内源性和外源性信号提示作出反应。CR的体细胞改变或错误表达可能会对染色质的表观基因图谱进行重新编程,从而导致广泛的常见疾病,尤其是癌症。今天我们就一起来看这个通过高通量的数据分析和文献挖掘构建的CR在人类癌症的综合注释和可视化数据库——CR2Cancer数据库。
CR2Cancer数据库(http://cis.hku.hk/CR2Cancer/)的开发者来自香港大学,数据库相关文章(PMID: 29036683)于2018年1月发表在Nucleic Acids Research杂志(2019IF=11.501)上。截至2021-04-23该数据库相关文章已引用2次(数据来源:PubMed)。
开发者收集并整合了400多个不同癌症类型的CR的基因组、转录组、蛋白质组、临床和功能信息。开发者还建立了多种类型的CR相关关系,包括肿瘤类型依赖性(CR靶点和miRNA-CR)和独立性(蛋白-蛋白相互作用和药物靶点)的CR相关关系。此外,开发者还从5007份出版物中手工整理了约6000项癌症发展中CR的异常分子改变和相互作用。
浏览
1
肿瘤类型
2
功能
3
突变率
4
差异表达
5
ChIP-Seq数据
6
药物
检索
支持简单检索、批量检索、癌症类型检索和高级检索四种。
简单检索
批量检索
癌症类型检索
高级检索
下载
支持下载之前提到的所有数据。
总之,CR2Cancer提供了一个用户友好的web界面,可以方便地浏览、搜索和下载感兴趣的数据。我们相信该数据库将成为癌症表观遗传学研究和潜在临床应用的宝贵资源。
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