中药研究常用的数据库和网站:TCMGeneDIT、BATMAN
很多同学从事的是中医药领域的科研,相对来说,中医药发表文章比较困难,能发到Scientific Reports,Oncotarget和Cellular Physiology and Biochemistry 这种5分上下的杂志上已经比较困难了,虽说这几个杂志的声誉不太好,毕竟影响因子在这里。从基金的角度来说,大家的总体感觉是中医药方向的基金比较好中,每年基金中标的申请人里面也有一些的没有SCI文章的。今天我们换个角度,梳理下中药研究中常用的数据库和网站。
1. TCMGeneDIT:http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/
收录的信息包括:中药、基因、疾病、成分和疗效:
我们可以通过基因名、疾病名、中药名进行搜索,比如根据疾病阿尔茨海默症进行搜索,就可以看到有关的中药和基因以及文章数量:
还可以看到它们之间的关系图:
这样我们就建立了中药——基因———疾病的联系,接下来围绕基因展开上下游研究就可以了。
2. TCMID(Traditional Chinese Medicines Integrated Database):http://www.megabionet.org/tcmid/
TCMID也有类似的功能,比如我们看到关于处方二神丸的介绍:
这里看到一位中药破故纸,还以为是这个呢:
原来是这个:
破故纸,又名:补骨脂,婆固脂,胡韭子,种子入药,有补肾壮阳、补脾健胃之功能,并可治牛皮癣等皮肤病。
3. BATMAN-TCM:http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/
我们可以直接输入中药拼音查有关的化合物以及基因,比如六味地黄汤的化合物以及基因结果:
输入拼音后预测到的化合物和基因:
对这些基因进行的通路、疾病和GO功能注释:
建立的网络关系:
BATMAN-TCM是最好用的,功能也比较齐全。
下面我们列举一些2018年的中药项目供大家参考:
- 潺槁木阿朴菲生物碱类PTP1B抑制剂的发现及其改善胰岛素抵抗作用机制研究
- 麻黄细辛附子汤干预ILC2s介导2型免疫应答治疗AR机制及其拆方研究
- 中药复方贞术调脂胶囊通过调节A-FABP介导的脂肪-卵巢对话干预多囊卵巢综合征的作用及机理研究
- 防己黄芪汤系统调控EMT抗乳腺癌侵袭转移的研究
- 复方蜥蜴散凝胶对PLGC模型大鼠胃肠道微生态平衡及PI3K/Akt/mTOR信号通路的调控作用研究