中药研究常用的数据库和网站:TCMGeneDIT、BATMAN

很多同学从事的是中医药领域的科研,相对来说,中医药发表文章比较困难,能发到Scientific Reports,Oncotarget和Cellular Physiology and Biochemistry 这种5分上下的杂志上已经比较困难了,虽说这几个杂志的声誉不太好,毕竟影响因子在这里。从基金的角度来说,大家的总体感觉是中医药方向的基金比较好中,每年基金中标的申请人里面也有一些的没有SCI文章的。今天我们换个角度,梳理下中药研究中常用的数据库和网站。

1. TCMGeneDIThttp://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/

收录的信息包括:中药、基因、疾病、成分和疗效:

我们可以通过基因名、疾病名、中药名进行搜索,比如根据疾病阿尔茨海默症进行搜索,就可以看到有关的中药和基因以及文章数量:

还可以看到它们之间的关系图:

这样我们就建立了中药——基因———疾病的联系,接下来围绕基因展开上下游研究就可以了。

2. TCMID(Traditional Chinese Medicines Integrated Database):http://www.megabionet.org/tcmid/

TCMID也有类似的功能,比如我们看到关于处方二神丸的介绍:

这里看到一位中药破故纸,还以为是这个呢:

原来是这个:

破故纸,又名:补骨脂,婆固脂,胡韭子,种子入药,有补肾壮阳、补脾健胃之功能,并可治牛皮癣等皮肤病。

3. BATMAN-TCMhttp://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/

我们可以直接输入中药拼音查有关的化合物以及基因,比如六味地黄汤的化合物以及基因结果:

输入拼音后预测到的化合物和基因:

对这些基因进行的通路、疾病和GO功能注释:

建立的网络关系:

BATMAN-TCM是最好用的,功能也比较齐全。

下面我们列举一些2018年的中药项目供大家参考:

  1. 潺槁木阿朴菲生物碱类PTP1B抑制剂的发现及其改善胰岛素抵抗作用机制研究
  2. 麻黄细辛附子汤干预ILC2s介导2型免疫应答治疗AR机制及其拆方研究
  3. 中药复方贞术调脂胶囊通过调节A-FABP介导的脂肪-卵巢对话干预多囊卵巢综合征的作用及机理研究
  4. 防己黄芪汤系统调控EMT抗乳腺癌侵袭转移的研究
  5. 复方蜥蜴散凝胶对PLGC模型大鼠胃肠道微生态平衡及PI3K/Akt/mTOR信号通路的调控作用研究
(0)

相关推荐

  • 生信数据挖掘,怎么能缺少这个数据库呢

    今天给大家分享一个数据库,这个数据库就是人类基因组流行病学导航数据库(HuGE  Navigator).这个数据库提供了人类基因组流行病学研究,包括以下这些方面:基因变异的人群流行率信息.基因与疾病的 ...

  • 工具篇丨假期发篇网络药理学的文章就靠它们了!

    由于疫情的影响,今年又是一个比较漫长的寒假.实验无法推进,手头没有足够的数据写文章,这个假期怎么利用好呢?不急,我们还有网络药理学!有的小伙伴可能会说这是针对中医专业的发文套路,No, No, No, ...

  • 别眨眼!5分钟教你用一个中药调控基因靶点研究的数据库

    ↓ 如果您或者科室有科研上的困扰 扫码备注:科研合作

  • 处方不懂怎么用?中药靶点和疾病相关基因网络图不会做?TCMID来帮您

    中医药综合数据库(TCMID)是一个有关中药各个方面的数据库,包括配方,草药和草药成分,药物和疾病的信息.目前的TCMID包含约4.7万个处方,8159种草药,25210种化合物,6828种药物,37 ...

  • 最强攻略6:史上最全网络药理学数据库汇总解读

    网络药理学主要是通过系统生物学的研究方法进行研究,使用统计学.复杂网络等数学手段,能够在分子水平上更好的理解细胞以及器官的行为,加速药物靶点的确认以及发现新的生物标志物.网络药理学用网络科学的方法研究 ...

  • 哦嚯,一键即可打包中药成分预测、靶点、通路、关联疾病?

    一个中药复方通常由许多天然产物组成,如草药.动物药和矿物药,每一种都含有大量的化学分子.复方中的活性化合物与特定疾病相关的功能失调蛋白相互作用,从而治疗该疾病.因此,对中药有效成分及其作用靶点的鉴定, ...

  • 常用的生物学数据库及网站介绍

    在这个信息大爆炸的年代,浩瀚的信息流如同汪洋大海一般,将每个人都紧紧环绕.如何利用已有的工具从中筛选有用信息,对我们每个人,尤其是科研人而言,尤为重要. 今天小编就给大家分享一些咱们科研过程中常常会用 ...

  • 编辑常用标准规范/常用数据库及网站

    ❋ 一.法律.法规.规章.国际公约 编辑须重点学习掌握 二.标准和规范 <标点符号用法>(GB/T 15834-2011) <出版物上数字用法>(GB/T 15835-2011 ...

  • 活血化瘀中药的常用3种组合

    原创 蔡柏 廖凯明 悦读中医 昨天 小编导读 活血化瘀药物是临床常用的一类中药,不过属于此类的药物很多,不同的活血药各自具有特点,而利用它们的特性进行合理搭配则会让治疗效果事半功倍.今天就为大家介绍名 ...

  • 国内外最常用37个学术网站

    历史不是历史学家的特权,甚至正如后现代主义所主张的,也不是一种历史学的"发明".不如说,它是一种社会形式的知识,在任何既定的情况下,都是众手集成的工作.--拉斐尔·萨缪尔<历 ...

  • 这三组中药,常用来活血化瘀

    活血化瘀药物是临床常用的一类中药,不过属于此类的药物很多,不同的活血药各自具有特点,而利用它们的特性进行合理搭配则会让治疗效果事半功倍.今天就为大家介绍名老中医使用活血化瘀药时常用的3种组合. 01 ...

  • 国内外最常用38个学术网站

    历史不是历史学家的特权,甚至正如后现代主义所主张的,也不是一种历史学的"发明".不如说,它是一种社会形式的知识,在任何既定的情况下,都是众手集成的工作.--拉斐尔·萨缪尔<历 ...

  • 心肌功能研究常用的动物模型

    心肌功能研究常用的动物模型

  • 古今中药研究:芦根

    一.典籍摘要: <本草经集注>陶弘景:味甘,寒.主治消渴,客热,止小便利. <药性论>:"能解大热,开胃.治噎哕不止." <唐本草>:" ...

  • 延缓衰老的中药研究

     延缓衰老的中药研究 随着我国老年医学的兴起和发展,从七十年代末开始,对抗衰老药物的研究日益受到重视,收集研究的药物有四百种之多,兹将其概况简述如下: (一)调节机体免疫功能 调节与改善机体的免疫功能 ...