m6A-meRIP-seq结果解读（五）

③生信分析结果

（1）如何进行数据筛选？

大体了解分析流程和分析结果后，小编建议您可先从联合分析结果部分进行感兴趣或候选基因筛选，筛选策略如下：（1）已有候选基因：可直接进行筛选；（2）暂无候选筛选目标时，可以从FC值和P值角度进行后续基因筛选；（3）由于m6A可能调控基因的表达，因此可以从其上下调情况进行筛选，如筛选2者表达趋势相反基因，当然这只是其中一个筛选标准，后续需基于具体筛选目标做相应调整；（4）此外，也可基于文献的筛选策略进行数据挖掘。在实际数据筛选过程中，需基于实际情况不断调整筛选策略，以期尽可能获得满意分析结果，从而对下游实验有所帮助。

（2）如何看Motif分析结果?

RNA甲基化修饰以及去甲基化修饰起始于多种结合蛋白与发生甲基化位点的Motif相结合。Motif本质上是一种具有生物意义的核酸序列模式，这些RNA甲基化相关的酶可识别这些Motif并与之结合，从而影响基因的表达。基因表达调控机制研究是生物学研究的重点内容，鉴定这些motif，对于基因表达调控机制研究具有重要意义。使用Motif分析软件在peak区域寻找可信度较高的motif，得到每个Motif的宽度、E-value、PFM、PSSM以及其在各个peak序列总的位置信息等等。我们针对每组样本以及差异结果进行motif预测。根据P值对预测到的motif进行排序，P值越小，排序越靠前。目前报道较多的motif结构为RRACH（ R代表A或G，H代表A、T、C），后续可基于此进行motif查找。

（3）个性化分析图片绘制

为更好更准确的获得预期的图片效果，建议您直接提供例图及其对应的参考文献，我们的技术工程师将尽快给出反馈并进行个性化图片绘制。