5分+单基因泛癌纯生信 投稿到发表不到一个月！
大家好，今天要和大家分享的是2021年2月份发表的一篇文章：“Pan-CancerAnalysis Shows TP53 Mutations Modulate the Association of NOX4 with GeneticPrograms of Cancer Progression and Clinical Outcome”；
发表杂志：Antioxidants
影响因子：5.01 即时影响因子：6.07
被致谢！2021年7分+单基因泛癌纯生信，投稿到接受30天！
该文章1月7号投稿，2月1号接收，2月4号就发表了，除了BBRC，这是我见过最快的了。
作者团队既往研究表明：TGF-β诱导NOX4表达参与上皮间质转化（EMT），并且p53野生和突变状态影响TGF-β诱导NOX4表达，在几种肿瘤细胞模型中WT-p53和Mut-p53分别抑制和上调NOX4 mRNA和蛋白质表达。因此，作者试图通过分析TCGA中肿瘤样品的全外显子组数据来验证和扩展。
在这篇文献中，作者旨在揭示TP53突变可调节NOX4表达，并且与肿瘤进展和临床预后相关。作者利用TCGA的23种肿瘤的基因组及转录组测序数据构建了泛癌种数据集，探讨了NOX4表达与p53突变状态、EMT通路、生存预后的关系。分析显示：在部分癌症中，NOX4 mRNA随癌症进展而表达增加，与EMT、细胞粘附、迁移和血管生成等过程相关；且NOX4高表达预示着Mut-TP53患者不良预后，而对WT-TP53患者预示着较好预后。此外，在Mut-TP53患者中，NOX4与凋亡通路负相关，与增殖通路呈正相关，这与其较差的生存率一致。这些发现表明，TP53突变可能通过激活癌症进展通路策反NOX4，将其从保护性因素转变为有害因素。
数据来源及筛选：
分析流程：
结果部分：
1.NOX4表达与疾病分期之间的关系分析显示：进展期肿瘤更高表达NOX4；
2.探究p53 wt/mut两组中p53 mRNA与NOX4 mRNA表达的关系，两组呈现相反趋势，其中，Mut-p53与NOX4 mRNA正相关；
3.NOX4与EMT、血管生成等肿瘤进展通路基因的相关性分析；
4.既往报道NOX2与巨噬细胞产生活性氧相关，作者进一步分析NOX家族与巨噬细胞的相关性;
5.分析p53 wt/mut状态下与EMT通路基因的相关性；
6.Kaplan–Meier分析p53 wt/mut组NOX4对预后的影响；
7.分析p53 wt/mut对增殖、凋亡的影响。
最后，作者给出p53野生及突变状态对肿瘤NOX4表达及生物学过程的影响。