这种套路,你造吗

这篇文章题目:ZNF154 is a promising diagnosis biomarker and predicts biochemical recurrence in prostate cancer

文章来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=ZNF154+is+a+promising+diagnosis+biomarker+and+predicts+biochemical+recurrence+in+prostate+cancer

发文套路:

1、从TCGA和GEO上下载甲基化数据和RNAseq数据

2、对甲基化数据做差异分析,筛选出有差异的基因

3、在众多的基因中,发现ZNF154最值得后续分析

4、拿ZNF154到Oncomine中验证,发现也是有差异的

5、甲基化位点与mRNA的表达水平相关性分析

6、对ZNF154做共表达分析,对前100个共表达基因做功能分析

7、收集病人样本,进行定量PCR,发现ZNF154也是有差异的

8、绘制ROC曲线,确定诊断价值

9、ZNF154甲基化与临床性状的相关性分析

11、进行Cox回归分析

11、进行生存分析,确定各位点甲基化水平预后价值

最终,发现ZNF154能够作为诊断前列腺癌生物标志物,并且能够预测复发

(0)

相关推荐

  • 文献解读丨甲基化生信分析新思路发5分文章

    专注生物分析最前沿 定期解读生信文章 提供生信分析思路和套路 方便大家短平快发SCI 关于甲基化方面的探索,传统的方法无非是现在公共数据库中下载数据,差异分析构建模型,外部数据验证或者与靶基因相关性分 ...

  • 肿瘤预后相关DNA甲基化数据库

    肿瘤预后相关DNA甲基化数据库

  • DiseaseMeth:人类疾病甲基化数据库

    导语 DiseaseMeth 是一个专注于人类疾病的异常甲基化数据库,不仅包括多种癌症,同时还包括神经发育和退行性疾病.自身免疫疾病等数据集.其中DNA甲基化芯片包含了这两种常见的illuminaDN ...

  • 讨厌一个人不用翻脸,学会几个套路,不仅解气而且有格局

    图/电影<肖申克的救赎>剧照 今年过年的时候,朋友小敏在朋友圈发了这样一段话,她说:"如果说新的一年只能有一个愿望的话,我希望我即便再讨厌一个人,也不用急着翻脸,急着删掉他的微信 ...

  • 高考理综如何答题,才能“撩”到阅卷老师?满满都是套路!

    高考理综如何答题,才能“撩”到阅卷老师?满满都是套路!

  • 套路

    神器认主 英雄救美 扮猪吃虎 以弱胜强 力挫群雄 贵人相助 临危受命 装逼打脸 比武大会 寻宝之旅 慧眼识真&因祸得福 好人有好报 傲慢与偏见 复仇之路

  • dr5修图扩展滤镜免费分享,无套路

    回复 "5"  可以下载. DR3/4/5.Beauty Retouch  是在Photoshop里录制的动作,通过软件转换成扩展在添加在Photoshop. 上面这个图就是制作D ...

  • 年终奖发放,HR必须要懂得套路!

    又到年底了,年终奖会发多少呢?去年有人说发个毛,有人说发个鸟,还有人说发个锤子,今年更加困难,不知道要发个啥?年终奖,都说是地主家的余粮.有的公司是领导拍脑门,今年业绩好多发,业绩不好少发,这样的年终 ...

  • 寻龙诀7.17:题材分歧阶段的操作套路

    自从决定满仓打板之后,出手变得非常谨慎.昨天憋了一天没出手,这样总不是办法,于是今天盘前考虑市场如果不好,先开半仓,但只买1只股.于是开盘噼里啪啦打板了半仓金安国纪,顺利封到收盘,算是开了个好头. 今 ...

  • 3.19复盘:情绪转折的套路

    明后两天全天不能看盘,复盘和直播暂停两天,周四回归.今天讲讲情绪转折,留给大家消化. 今天最大的看点就是万兴科技,但我昨晚操作计划做的不好,只猜测了上午或是下午价崩,没考虑直接顶加速的情况. 不考虑今 ...

  • 2017.12.1日复盘:套路

    2017.12.1日复盘:套路

  • 短开衫是怎么让小个子女生显高的?全靠这3个搭配套路

    Hello各位姐妹~ 我发现不少女星都趁着假期外出游玩,比如Lisa和Jisoo便来了一次姐妹约会,神仙友情真让人羡慕啊! 具体来看下两人的游客造型:Jisoo以长袖衫搭配牛仔裤,整体穿扮算是比较中规 ...