R代码很容得到，关键是数据不会准备，遇到问题看不懂
R代码真的很容易得到，例如GOplot包的代码，百度一下就得到了：http://wencke.github.io/, 没有错这是这么简单，可以直接复制+粘贴
library(GOplot)# Load the datasetdata(EC)# Get a glimpse of the data format of the results of the functional analysis... head(EC$david)# ...and of the data frame of selected geneshead(EC$genelist)# Generate the plotting objectcirc <- circle_dat(EC$david, EC$genelist)chord <- chord_dat(circ, EC$genes, EC$process)# Generate the matrix with a list of selected geneschord <- chord_dat(data = circ, genes = EC$genes)# Generate the matrix with selected processeschord <- chord_dat(data = circ, process = EC$process)# Create the plotchord <- chord_dat(data = circ, genes = EC$genes, process = EC$process)GOChord(chord, space = 0.02, gene.order = 'logFC', gene.space = 0.25, gene.size = 5)。。。
看到官网给的代码好简单呀，自己直接复制到R，结果也出来了，而且很漂亮：
这是直接用R包自带的数据来做的，肯定非常简单的。现在问题来了，自己怎么准备数据？
这也是很多临床医生比较头痛的问题，当然对R比较熟悉的会自己准备，但是很多初学者搞数据挖掘根本自己看不懂，也不会准备，特别是R报错的时候，更加头痛了，绝大多数据R报错也是数据出现了一些小问题，只是看不懂而已。
现在有非常多论坛或者公众号都经常会分享一些代码，例如（GOplot,WGCNA等等）然而绝多数都是用R包自带的数据，然而对很多人来说并没有卵用，因为需要什么数据都不知道，怎么读入也不知道。很多老师讲课也很喜欢用R自带数据来讲，因为这样比较方便，但是学员就惨了，因为数据不知道怎么样准备与读入，后面的分析再怎么样整都没有卵用。
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