茶树光响应过程中的内参基因选择

茶树是一种重要的木本经济作物，用于加工茶饮料。众多的研究表明，光是控制茶树生长和代谢的必要环境条件。然而，用于系统分析光诱导转录机制的 qRT-PCR 内参基因在茶树中仍然不可用。这项研究发现肌动蛋白（actin）家族基因在茶树中的各种表达实验中可以被广泛用作参考基因，并且没有区别。六对actin基因引物（对应于CsACT1，CsACT2，CsACT（3-4），CsACT（5-6），CsACT（7-8），和CsACT（9-10）基因）被设计来评估它们响应光质（LQ），光强（L1），和光周期（PD）时的表达稳定性。同时，其他六个家族成员（CsUBC1，CsCLATHRIN1，CsGAPDH，CsTBP，CsTIP41，和CseIF-4α）也被用作参考基因进行了研究。基因表达的稳定性排名由geNorm，BestKeeper，NormFinder，和RefFinder软件的统计算法来计算。CsACT（5-6），CsTIP41，和CsACT（3-4）在光质，光强（L1），和光周期（PD）处理中分别是最稳定的内参基因。这项研究提供了参考基因的选择对于未来在茶树光响应的激活机制的研究奠定了基础。在看家基因家族的各个成员的表达稳定性的研究将有助于指导检测引物的精确设计和表达实验阐明转录的机制。