2021.10在线数据库汇总

10月期间 ,总共发表了医学相关在线数据库49个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库。如果想要所有相关数据库信息的,后台回复:==2110==。

疾病和药物相关数据库

在这个部分,一共发表了5个数据库 。其中有四个是和药物有关的数据库。

其中Inxight Drugs 是一个由NIH 创建的药物综合性检索数据库。

我们可以在里面了解一些基本药物的化学结构,靶点以及简单的作用机制。

微生物和病毒相关数据库

在这个部分,总共发表了8个数据库 。加上前面疾病的那个COVID19数据库,相当于一共有3个 COVID19 相关数据库了。

随着对于 COVID19 研究的逐渐深入,目前这类的数据库的数据和类型也就越来越多。甚至出现了关于 COVID19 的单细胞数据库:

DNA相关数据库

在这个部分,总共发表了 7 个数据库。在7个数据库里面。有三个是和表观遗传有关的。

其中 scMethBank-single cell Methylation database 是一个在单细胞水平来关系DNA甲基化变化的数据库。

我们之前介绍的很多甲基化数据库主要都是基于 TCGA 来构建的。对于这类单细胞水平的数据库倒是可以了解一下。

1.     [[DiseaseMeth-疾病相关甲基化分析数据库]]

2.     [[SurvivalMeth-肿瘤预后相关DNA甲基化数据库]]

3.     [[DNMIVD-泛癌DNA甲基化分析数据库]]

4.     [[EWAS Atlas-不同疾病甲基化状态查询数据库]]

5.     [[MEXPRESS-TCGA甲基化和表达相关分析]]

RNA相关数据库

在这个部分,总共发表了 11 个数据库。其中包括了两个更新版本的数据库。

RNALocate 是一个用来预测 RNA定位的数据库。我们在之前介绍[[RNALocate_lncLocator_iLoc-LncRNA-预测lncRNA亚细胞定位的网站]]的时候介绍过这个数据库。目前更新到了 2.0的版本。有兴趣的可以了解一下。

另外,在circRNA靶基因预测方面,之前介绍[[circRNA相互作用预测#CSCD]]当中的CSCD2.0也更新了 2.0 版本。如果想要预测 circRNA靶基因的话,可以看一下这个数据库。

蛋白相关数据库

在这个部分,总共发表了  9  个数据库 。

其中,在蛋白基本表达的研究方面:HBFP是一个用于体液方面蛋白表达检测的数据库。如果想要发现一些体液当中分泌哪些蛋白的可以尝试一下这个。

流程化分析数据库

在这个部分,总共发表了 4 个数据库 。

其中, SignaLink 是一个用来分析基因组织特异性相互作用的数据库。

其他方面数据库

在这个部分,总共发表了 4 个数据库。

之前在介绍小鼠的免疫浸润分析的时候,提到过[[TISMO-老鼠免疫浸润评价数据库]]。关于这个方面,ImmuCellAI_mouse也是一个用来分析小鼠免疫细胞丰度的数据库。

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