学习生物信息学数据挖掘一定要学习Linux吗?
一谈到生信,大家就会想到Linux,说做生物信息学就一定学习Linux。于是,生信数据挖掘也联想到了Linux。那到底做生信数据挖掘要不要一定学习Linux?答案是否定的,做生信数据挖掘完全没有必要学习Linux。即使是转录组或其他测序数据,window系统都可以完成,只是window系统效率没有Linux高,熟练Linux命令后,Linux一条命令能完成的工作,在window系统鼠标要点一万下。此外,Linux系统比window安全,不容易感染病毒,例如上次某病毒,侵入电脑后数据就被锁上了,要给钱才能要回来,特别是一些大医院,研究机构,丢了数据真的要命了,不过有些单位用了Linux就没有被感染。总的来说,Linux是做生信的主流,专业做生信的人,肯定会Linux。
做生信数据挖掘,根本不需要Linux。
第一,做数据挖掘一般数据量比较小,32g内存window电脑基本能通杀。
第一,很多临床医生做生信数据挖掘就是为了发文章,搞科研的时间不多,你本来学习Python,Perl ,R这些都要一两年,如果你在要掌握Linux,估计再加多一年,这样你学编程就要花三年,到时候可能又改朝换代了。
当然,如果你是为了兴趣,你有足够的时间,学习好Linux,那就最好了。
还有一个疑问,Linux全部是黑麻麻的吗,全部需要命令才能操作吗?
也不是这样子的,Linux也可以可视化,有菜单操作,但是用菜单效率就慢了。
图一为全命令模式:
图二为可视化操作:
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SCI狂人团队
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