你只会用生信数据挖掘发文章,却不会利用它设计课题

很多人都知道怎么样利用生信数据挖掘发文章,却忽略了利用它怎么设置课题。现在离申请基金的日子越来越近了,很多人都在准备撰写基金,如果没有思路该怎么办呢?没有思路的同学可以考虑一下这种方法。

1、从TCGA上下载数据

2、做差异分析

3、对差异基因做GO、KEGG富集分析

4、PPI分析及筛选hub基因

5、将hub基因在Oncomine中进行验证

6、进行生存分析,筛选靶标

做完上面的分析完全可以发文章了,但是我们还可以设计基金课题。

对筛选出来的靶标进行实验验证

1、收集病人的样本

2、提取总RNA,进行qRT-PCR

3、蛋白印迹

4、免疫组化

5、对病人进行长期随访,收集生存数据进行生存分析

6、还可以进行预测模型

条件允许可以进行预实验,这样的话申请基金更加把握。

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