你只会用生信数据挖掘发文章,却不会利用它设计课题
很多人都知道怎么样利用生信数据挖掘发文章,却忽略了利用它怎么设置课题。现在离申请基金的日子越来越近了,很多人都在准备撰写基金,如果没有思路该怎么办呢?没有思路的同学可以考虑一下这种方法。
1、从TCGA上下载数据
2、做差异分析
3、对差异基因做GO、KEGG富集分析
4、PPI分析及筛选hub基因
5、将hub基因在Oncomine中进行验证
6、进行生存分析,筛选靶标
做完上面的分析完全可以发文章了,但是我们还可以设计基金课题。
对筛选出来的靶标进行实验验证
1、收集病人的样本
2、提取总RNA,进行qRT-PCR
3、蛋白印迹
4、免疫组化
5、对病人进行长期随访,收集生存数据进行生存分析
6、还可以进行预测模型
条件允许可以进行预实验,这样的话申请基金更加把握。
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