分类学和分类学家面临的发展问题

生物系统学是一门发现、描述、分类和命名生物的科学。它起源于亚里士多德，因此是生物学中最古老的学科。它是研究生命及其结构、功能和进化的所有其他学科的基础。分类学知识是最重要的，无论是研究整个有机体、器官、特定的生物分子还是生物化学途径。在一些研究中，对一个物种的鉴定会影响所有后续的比较、预测和可能的研究重复。可能有人会认为，当研究膜运输机制、植物光合循环等基本过程时，对研究对象的鉴定是无关紧要的。然而，情况并非如此，因为许多生理过程途径是有机体适应特定的环境条件的产物，当结论推广到所研究生物体之外的范围时必须考虑这一点。例如，Thermus aquaticus Brock & Freeze, 1969 仅在温泉中存在，是已知(并以)具有taq-聚合酶的唯一物种。

生物学的基本任务之一是了解地球上存在哪些生物。迄今为止，已经描述了大约200万个物种，实际的物种多样性估计从400万到1200万不等。但是，在人类影响和气候变化背景下的物种正在以更快速度消失时，物种发现和描述的科学-分类学也面临危机。尽管国内外针对分类学的复兴和人才培养实施了一些措施，但是仍然存在很多问题。

分类学专业毕业的学生在找工作时，尤其是在学术界，分类专业知识一般很少是岗位必需的，甚至可以没有分类学知识。

此外，大多数顶级的进化期刊不考虑分类学修改，只允许某些例外情况下的如引人注目的化石和哺乳动物的物种描述发表。一些排名较低的期刊也拒绝分类描述，除非是涉及更广泛主题的论文中(例如，ournal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 见作者指南http://www.blackwellpublishing.com/journals/jzs)。专注于分类学的期刊通常影响因子不高影响也不大，即使是新的、充满活力的、发表快速的Zootaxa。

分类学文章影响较小的一个原因是不引用分类学假设的传统，这样的惯例严重阻碍了分类学作为一门学科的崛起。

作为基础科学之一的分类学面临的危机

分类学通常被认为没什么知识内容的描述性科学，主要功能是鉴定。这样的学科很容易被取代，例如，使用DNA条形码技术。这种观点是错误的。分类学上的界限是科学假设，理想情况下是来自多个来源的证据，这不仅为我们的科学交流也为跨物种比较提供了基础，而且分类学结论也是可检测的。

无论种群A和B是被假设(通过分类描述)是同种的还是异种的，都对A和B的属性做出了完全不同的预测。如果同种的，可以预期A和B间有某种程度的基因流，A和B个体之间的繁殖是没有问题的，A群体中的雄性的行为会被B群体中的雌性理解等等。如果是异种的，则可预测基因流接近或为零，且AB存在杂交障碍。尽管大多数生物学依赖于分类学假设，但分类学学科并不太受待见，成果只在少数影响不大的期刊上发表。科学工作者在使用分类名称(假设)时候，很多时候不会引用它们的作者，从而忽视了分类学的科学内容及其对研究的影响。

分类学是对一个陌生星球的先锋型探索，发现、描述和分类我们星球上的物种的目标无疑是大科学，如果没有分类学，系统发育学就很贫乏，生态学失去了一个基本的货币单位，保护生物学失去了重点和目标。分类学对保护和规划决策产生深远而长久的影响。一些极具商业开采价值的物种在最新描述的时候分类学家还不得不考虑隐藏其具体坐标信息。

那么为什么期刊不愿意考虑发表分类描述呢？尽管主要资助机构和新一代训练有素的分类学家已经认识到其价值，但为什么分类工作仍然稀缺？

总而言之，为什么分类学似乎是穷人的科学？

主要的问题和解决办法

影响分类学的一个主要障碍是一种特殊惯例的结果：人们认为没必要引用原始的分类学描述或随后的分类学修订——即物种名称背后的假设——即使这些假设对研究设计有至关重要的影响。当讨论一个物种时，生物期刊可能(也可能不)要求在文本中列出它的拉丁名和作者，但该作者的工作没有出现在引用文献中。

例如，Web of Science发现超过35000篇论文(谷歌Scholar超过60,000篇)讨论的是常见的黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)，由Meigen在1830年描述，但Meigen(1830)被引用不到60次。显然，黑腹果蝇假说对科学产生了重大影响，但按照惯例，这一分类假说并未引起人们的注意。这是期刊避免发表分类学论文的主要原因：它们不太可能被引用，从而降低了期刊的总体影响因子。

图：一些著名物种相关的文章以及该物种原始描述的引用

那么，是不是所有涉及到分类学名称的都有引用原始分类描述或者分类学修订呢？这样做的话从形式上看，一篇生态学论文的文献引用的篇幅可能超过正文，但这是无关紧要的。分类学也不能这样制作不痛快。但是涉及到分类学为研究提供了帮助的地方应该引用，比如生态学研究中，那些不太容易鉴定的物种的分类学描述。因为这些分类学描述为生态学研究中的那些难以鉴定物种的分类学假定提供了分类学依据。

分类学是一门充满活力的学科，它的假设是不断被测试、更新和改变的。改进分类学引用的做法，除了那些原始的分类学描述作者收益外，更多的对分类学进行修订的新的分类学者也会从中收益，从而改进分类学中的问题。很多原始描述提供的信息是有限的，但是最新的分类修订提供了更充实的证据来对分类学假设进行测试和补充，物种的描述和鉴定信息更加准确。

正如任何其他科学假设，分类学工作应该被引用。一旦分类学享有平等的引用，将对分类学家获得期刊青睐和资助资金产生积极的影响，增加对分类学家的工作需求，并增加学生对掌握这门学科的兴趣。

当然，分类学工作引用不高的责任也在于分类学家自己。和其他科学出版物一样，分类学论文的影响取决于它们的内容。例如，可能目前发表的大多数分类学论文几乎都是纯描述性的，并且仅限于形态学。尽管这些论文很有价值，但对其他研究人员来说，它们提供的物种假设测试相对薄弱，而且提供的分类工具很少。提供额外的信息，如行为、自然史、物种条形码、易于使用的识别工具和系统发育假说，将增加分类学论文的影响力。