茶树种群的代谢特征
Metabolite signatures of diverse Camellia sinensis tea populations.
茶树种群的代谢特征
*Nature communication
茶树提供了一个出色的系统,可以研究专门代谢产物的众多类别,类型和可变含量的演变和多样化。在这里,我们使用从中国136个代表性茶种中采集的鲜叶的转录组和代谢组学数据,研究中华绒螯蟹的系统发生群与专门代谢物之间的关系。我们获得了925,854个高质量的单核苷酸多态性(SNP),从而可以将采样的茶种细化为五个主要进化枝。非靶向代谢组学分析检测到分别以正电离和负电离模式在不同茶组中差异积累的129和199种带注释的代谢物。每个系统发生群均包含标志性代谢物。尤其是,CSA茶品的特征是各种类黄酮化合物(例如黄烷醇,黄酮醇单/二糖苷,原花青素二聚体和酚酸)的大量积累。我们的结果提供了对遗传和代谢产物多样性的见解,可用于加速茶树育种。
相关推荐
-
科研| Theranostics:宏基因组和代谢组学分析揭示了不同严重程度的慢性肾脏疾病中肠道微生物特征
编译:Mendelsohn,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 慢性肾脏病(CKD)是一种严重的疾病,与肠道菌群和循环代谢的特定变化有关.然而,CKD微生物的功能与疾病不同阶段宿主代 ...
-
科研 | Gut:基于血浆和血清代谢组学的多变量预测模型对慢性胰腺炎患者和非胰腺疾病控制患者的鉴别和验证
编译:微科盟红烧大肥鸥,编辑:微科盟Tracy.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 慢性胰腺炎(CP)是一种纤维炎性综合征,会导致器官功能障碍,慢性疼痛,胰腺癌风险增加和高发病率.目前的诊 ...
-
科研 | 福建农林大学:转录组和代谢组联合分析不同蓝光强度对茶树嫩芽的影响
编译:寒江雪,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 蓝光广泛调控植物的多种生理过程和次生代谢.虽然蓝光量(光照率)对植物很重要,但很少有人关注不同蓝光强度对植物尤其是茶树次生代谢调节 ...
-
综述 | 肠道代谢组:微生物与宿主之间的相互作用(IF:20.773)
本文由褚福浩编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 最近的研究进展提供给我们更多关于DNA序列和代谢物的数据,让我们能够更好的理解整体系统水平的肠道微生物群和代谢物之间的联系,更好 ...
-
科研| Pharmacol Res:代谢组学为胰腺癌及相关组织转移的精确诊断提供新的生物标志物(国人佳作)
编译:阿温,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 胰腺癌(PC)是恶性肿瘤中高死亡率的肿瘤之一,其发病机制复杂,潜伏期长,导致早期诊断手段严重缺乏.为了改善临床诊断和提高治疗效果,我们 ...
-
Front Microbiol | 宏基因组学,16S 扩增子、代谢组学联合表征非肥胖T2D大鼠肠道菌群组成、功能和粪便代谢表型
推荐:江舜尧 编译:团子菌 编辑:小菌菌 中南大学湘雅二医院彭伟军等人于2020年1月20日在微生物期刊Front Microbiol发表题目为<Integrated 16SrRNA Seque ...
-
技术贴 | MetaboAnalyst 4.0,代谢组学研究利器的升级
本文由面瘫的猫编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 MetaboAnalyst是一款基于网络的用于代谢组学数据分析.注释,并整合其他组学数据的工具套件.本文介绍了这一实用工具的更 ...
-
茶树茎尖和根中不同代谢特征的分子基础:MYB促进茶氨酸合成的表征
Molecular Basis of the Distinct Metabolic Features in Shoot Tips and Roots of Tea Plants (Camellia s ...
-
科研 | 中南大学:代谢组学分析揭示氨基酸和肉碱变化可作为银屑病的代谢特征(国人佳作)
编译:微科盟大陈子,编辑:微科盟Tracy.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 高通量代谢物分析为揭示代谢机制和识别生物标志物提供了更好的方法,银屑病是一种免疫介导的慢性炎症性疾病:然而, ...
-
科研 | 吉林大学:黄芪甲苷对顺铂诱导的大鼠急性肾损伤的保护相关代谢特征和生物标记物的改变(国人佳作)
编译:Y.too,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 顺铂(cis-diaminedichloroplatinum,CDDP)诱导的急性肾损伤(acute kidney inj ...
-
科研 | Clin. Gastroenterol.:健康生活方式下欧洲人群队列的代谢特征与结直肠癌风险
编译:孙元芳,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 有研究表明,人们遵循世界癌症研究基金/美国癌症研究所(WCRF/AICR)的指南,可以降低结肠直肠癌的风险.在欧洲癌症前瞻性调 ...
-
科研 | 重庆医科大Gut Microbes:妊娠期糖尿病肠道细菌和代谢特征改变及其相互作用
编译:Sunshine,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 越来越多的证据表明,肠道微生物群可以调节代谢稳态,从而可能影响妊娠期糖尿病(GDM)的发生发展.然而,在妊娠期糖尿病中, ...
-
科研 | Sci. China Life Sci.:基于不同饲料转化率模型筛选的高饲料利用率猪的养分利用及代谢特征解析
编译:何贝贝,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 现代集约化养殖生产中,排除相似的遗传背景和相同的日粮.饲养环境以及管理条件,不同个体在生长性能方面依然存在着比较明显的差异.近年来 ...
-
科研 | SBB:基于扩增子、宏基因组序列预测微生物群落代谢特征
编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 随着代谢组学技术的发展,尤其是以人类肠道中的微生物群落代谢组学为代表,为人们了解疾病患者体内被破坏的功能和稳态,分析不同调节途径之间的 ...
-
于君等又发GUT:肝癌患者的''肠肝轴代谢''特征 | 热心肠日报
今天是第1902期日报. 于君+黄炜燊+夏强:从肠入肝的代谢物变化或参与肝癌发生 Gut[IF:23.059] ① 纳入52名肝癌(HCC)患者和50名健康人的血清(门静脉和中央静脉).肝组织和粪便样 ...
-
于君等又发GUT:肝癌患者的'肠肝轴代谢'特征 | 热心肠日报
今天是第1902期日报. 于君+黄炜燊+夏强:从肠入肝的代谢物变化或参与肝癌发生 Gut[IF:23.059] ① 纳入52名肝癌(HCC)患者和50名健康人的血清(门静脉和中央静脉).肝组织和粪便样 ...