非编码RNA表达质粒载体
常规非编码RNA表达质粒载体是在多种哺乳动物细胞中转染和表达非编码RNA的高效工具。非编码RNA是一类长度小于30个核苷酸或者大于200个核苷酸的功能性RNA,包括:小分子RNA(micro RNA, miRNA)、小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)、Piwi蛋白互作RNA(piwi-interacting RNA, piRNA),小核RNA(small nuclear RNA, snRNA)、核仁小RNA(small nucleolar RNA, snoRNA)、基因间长链非编码RNA (large intergenic non-coding RNA, lincRNA)、内含子长链非编码RNA(intronic long non-coding RNA, intronic lncRNA)、天然反义转录物(natural antisense transcripts, NAT)、增强子RNA(enhancer RNA , eRNA)和启动子相关RNA(promoter-associated RNA , PAR)等。所有这些非编码RNA均不被翻译成蛋白质,但是在许多细胞生理过程中扮演了重要角色,如DNA复制、表观遗传调控、转录和转录后调控、以及翻译调控等。
常规的非编码RNA表达质粒载体使用RNA聚合酶II型启动子驱动用户定制的非编码RNA的表达,可采用组织特异性、诱导型、或者驱动强度不同的启动子以满足不同的实验需求。对于RNA聚合酶II介导的转录过程,其转录起始位点位于启动子的3'端,而终止位点位于Poly A序列。因此该载体的非编码RNA序列的转录本带有一些额外的上游和下游序列。
该载体可以用于转染多种类型的哺乳动物细胞。在生物医学领域,常规质粒转染是将质粒载体导入哺乳动物细胞中是最广泛的方法。虽然近年来开发了不少更为先进的基因导入载体系统(如慢病毒载体、腺病毒载体、AAV载体和piggyBac等),但常规质粒转染仍被大多数实验室使用,这主要得益于其在技术上的简便性以及在各种类型细胞中的高效转染率。常规质粒载体转染的关键特点是短暂性,并且在宿主基因组中的整合效率非常低(通常小于1%)。