无与伦比的华丽风行（桑基图）

桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。

如下图

那么桑基图在我们科研中有什么用处呢？目前我见过的最常见的两个用处，一个是展示某分组，与肿瘤分期，患者生存状态，另一种就是展示ceRNA网络中的lncRNA-miRNA-mRNA的关系，今天我们来简单实现一下，大家只要套用数据就可以画出自己的桑基图了。

安装加载包

install.packages("ggalluvial")library(ggalluvial)

载入数据

我们用的是自带的数据，来表示泰坦尼克号上乘客多维分类数据

titanic_wide <- data.frame(Titanic)head(titanic_wide)

画图

ggplot(data = titanic_wide, aes(axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age, y = Freq)) + scale_x_discrete(limits = c("Class", "Sex", "Age"), expand = c(.1, .05)) + xlab("Demographic") + geom_alluvium(aes(fill = Survived)) + geom_stratum() + geom_text(stat = "stratum", label.strata = TRUE) + theme_minimal() + ggtitle("passengers on the maiden voyage of the Titanic", "stratified by demographics and survival")

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