不会用Cytoscape这个软件？这篇7.691分的SCI文章教你，如何给你的Network图上美颜...

像这样的Network图，我相信大家应该都明白

，是从哪里来的了。嗯，这个就是STRING上的PPI图：

但是一般来说这样的Network图，大家都会下载后，再加载到Cytoscape上去，美化美化

，或者做个子网络的分析。但夏老师在PubMed上冲浪的时候，发现了这么一卦Network美容器

，发表在7.691分的Genomics Proteomics Bioinformatics上：

这个工具还挺有意思，

主要是对Network进行美化和注释的：

这个注释主要还是根据GO term和KEGG Pathway的注释来进行的

，首先就是输入Network数据，以及注释数据：

输入后

，就会形成这样的表格：

而Network也会在注释后

，形成初级图：

对于形成的Network，以及注释数据，

通过贪婪算法等等，会分析出Network的子网络：

以及根据Network中各个Node的注释

，形成的Network饼图：

子网络，也是有拓扑结构的

，按照算法的不同，形成不同的分区：

网络中的Node之间有交集的Edge

，也可以通过韦恩图来展示出来：

由于GO term和Pathway之间，其实是有交集的，

而只有的交集在2D平面上显示出来，就是一团乱麻，所以他们还做出了3D的Network图：

这是不是就比Cytoscape酷多了

……不同的色块来显示出不同的注释及聚类，让子网络中GO term和Pathway的聚集也一目了然…… 要看这篇文献，可以自己去PubMed上下搜一下。或者在评论区进行评论，就发给你们PMID号。实在不行就回复“公克”（不要在评论区回复

），要么就直接星球上见（当然，进不去也无所谓

）。好吧，今天就先给你们策到这里吧，祝你们心明

眼亮

。

封面：撒渔网 https://pic.sogou.com/

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