【Meta分析】PubMed更新千变万化如何火眼金睛?

系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法。在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公众号特此开设专栏解答,希望能够和大家共同学习交流Meta分析,共同成长,如有不当之处,还请大家批评指正。本期我们更新的是新版PubMed数据库的检索导出方法。

01

序言

PubMed数据库更新后,我们第一时间介绍了新版PubMed数据库的检索方法
【文献检索】PubMed数据库界面更新,检索方式有何变化?
【Meta分析】New PubMed数据库检索方法全面攻略
其中讲到导出文献时,点击Save,选择Format的RIS格式,但是近期有学员反映界面又发生了变化,RIS格式不见了。今天我们主要针对这一个小问题进行答疑

02

导出方法

我们讲万变不离其宗,不管PubMed如何变化,英文字母的含义总是一定的,这也是我反复跟学员强调的,我们课程中讲的是逻辑和方法,并不是让你照猫画虎点点鼠标,否则,只要一点不一样你就蒙圈了。接下来我们详细分析如何用火眼金睛去识别PubMed的更新。
首先我们来看更新后的导出选项,1. 在页面中多出了一个Send to,这与旧版的导出标示一致;2. 点击Save后,原来的RIS不见了,取而代之的是PubMed,这是不是意味着可以直接导出PubMed的文件,点击下载后可以发现是一个txt的文档。

并且数据的格式非常熟悉,这是旧版导出MEDLINE时的文件格式,这也就是意味着我们可以按照旧版的文件导入形式进行该文件的导入

而我们在课程中也为大家分享了不同数据库导入Endnote时的过滤器设置。
因此,进行相应设置后,可以发现导入成功了
第二种方法大家也可以从我们的导入设置发现,除了txt文档格式,还有nbib的格式,直接支持通过文献管理软件打开,而不用设置过滤器,在旧版中使用方法如下,但是发现最多只能导出200条,这也是我没有在课程中详述的原因,因为不实用。
但是这一功能在PubMed更新版中得到了改善,我们刚刚讲到的更新的另一大变化就是多了Send to,点击后可以发现出现了Citation manager,这也意味着我们可以直接导出nbib格式的文件,同时界面也更加友好,跟Save一样,支持一次性导出10000条以内的文献,当然也可以选择导出选定的文献或者该页面的文献。

03

其他

Q1. 个别同学在使用时发现打不开PubMed或者访问速度较慢?
这是由于PubMed服务器在国外,国内访问可能存在延迟的可能,目前该数据库是免费访问的,不存在收费的情况,同时国内也没有对其进行防火墙设置,因此建议更换网络如手机开热点或者使用谷歌浏览器进行访问等。
Q2: 过滤器创建不成功?
出现如图提示,则表明过滤器超出字符限制(4000字节),因此需进行删减,这对于我们影响因子的过滤器影响很大,目前的解决办法一是使用旧版PubMed进行检索,而是对表达式进行删减,需要将影响因子定的标准变高,或者选择自己感兴趣的期刊进行过滤器的创建(具体参见我们在课程中为大家整理的学科过滤器)。
Q3. 新增Associated data过滤器
在结果的侧边栏可以看到Article Attribute下有Associated data过滤器,笔者对这一选项是合含义不清楚,但是筛选后可以看到数量明显变少,同时部分研究下面具有Clinciatrials或者其他临床试验注册平台的注册记录,猜测可能是筛选出有关联数据的记录,如临床试验注册信息等。这对于我们进行Meta分析选题帮助很大,借助此功能我们可以看到研究领域下注册了哪些临床试验,比使用RCT过滤器可能更具有针对性
(0)

相关推荐