7-8月数据库汇总(截止8.21)(上)
在整个七月和八月份总共发表了在线数据库61个。这里我们基于前面两期的分类，主要汇总成了五个方面：疾病相关数据库，DNA相关数据库，RNA相关数据库，蛋白相关数据库，流程化数据库以及其他方面的数据库。由于内容较多，我们分成三个部分来进行简单的介绍。今天我们来简单的介绍一下疾病相关数据库以及DNA相关数据库。
如果想要的所有数据库汇总，可以回复：200708
疾病相关数据库
1.PCAT：儿科肿瘤相关数据库
PCAT(http://pcat.zhenglab.info)，数据库收集了儿科肿瘤相关的测序数据。利用这个数据库可以来分析相关测序数据的结果，
2.OncoPDSS: 基于临床证据的个性化药物治疗数据库
OncoPDSS(https://oncopdss.capitalbiobigdata.com)既可以作为癌症精准医学的综合知识库，也可以作为癌症研究人员和临床肿瘤学家的临床决策支持系统。它接受多组学改变作为输入，并将其解释为以药物治疗为中心的信息，从而帮助临床医生做出临床药物治疗决策。
3. ABC-GWAS: 雌激素受体阳性乳腺癌基因变异数据库
ABC-GWAS(http://education.knoweng.org/abc-gwas/)
4. Virus-CKB: 新冠综合性分析数据库
Virus-CKB(https://www.cbligand.org/g/virus-ckb)
5. PrGeFNE:疾病相关基因预测
PrGeFNE(http://bioinformatics.csu.edu.cn/prgefne/)是一个通过输入基因名即可获得疾病相关基因的数据库。
6. ExoBCD：综合性的乳腺癌外泌体数据库
ExoBCD(https://exobcd.liumwei.org)是一个基于以往研究的乳腺癌相关外泌体标志物数据库。
7. RadAtlas 1.0：辐射相关基因数据库
RadAtlas 1.0(http://biokb.ncpsb.org/radatlas)辐射相关基因数据库。利用这个数据库可以查询和辐射有关的基因。
8. MutEx：泛癌多组学分析数据库
MutEx(http://www.innovebioinfo.com/index.php)是一个基于TCGA数据库来分析多组学多癌种的数据库。
9. MENDA：抑郁症相关代谢数据库
MENDA(http://menda.cqmu.edu.cn:8080/index.php)是一个抑郁症代谢物的一个综合数据库，整合了抑郁症代谢特征的所有可用知识和数据集。
DNA相关数据库
1.SurvivalMeth: DNA甲基化预后相关数据库
SurvivalMeth(http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/survivalmeth), 利用多个公共的甲基化测序数据库来预测癌症预后相关的甲基化位点。具体的帖子可见：肿瘤预后相关DNA甲基化数据库
2. IDRMutPred：SNP变异引起的内在紊乱预测
IDRMutPred(http://www.wdspdb.com/IDRMutPred/)是一种特殊而准确的计算方法来预测疾病相关的基因内在紊乱区的非同义单核苷酸变异(nsSNVs)
3. HISTome2：组蛋白查询数据库
HISTome2(http://www.actrec.gov.in/histome2/index.php)一个查询参与组蛋白修饰相关蛋白的数据库
4. LDtrait：连锁不平衡相关数据库
LDtrait(https://ldlink.nci.nih.gov/?tab=ldtrait)在连锁不平衡中鉴定已知的表型关联的一个在线数据库。
5. PredCID：肿瘤相关移码突变数据库
PredCID(http://bioinfo.ahu.edu.cn:8080/PredCID)是一个用来预测肿瘤相关移码突变的数据库。
6.Deep4mC：4mc相关数据库
DNA N4 -甲基胞嘧啶(4mC)在不同物种的基因组中代表了一种新的表观遗传修饰。4mC修饰通过在DNA序列胞嘧啶的第4位添加一个甲基，不仅在DNA复制、细胞周期和基因表达的调控中发挥重要作用，而且参与基因组的稳定、重组和进化。Deep4mC(https://bioinfo.uth.edu/Deep4mC)通过多种算法来预测4mc调控位点。
7. LIST-S2：有害突变数据库
LIST-S2(https://list-s2.msl.ubc.ca/)是一个基于分类距离的预测蛋白质序列中氨基酸突变的危害性数据库。