戏说MALDI-TOF MS的“飞行时间原理”

要说清楚“飞行时间原理”应了解一个物理知识“动能”,即物体由于运动而具有的能量,用E表示,其中:m表示质量,v表示速度,L表示运动的距离,t表示运动L所用的时间,两个物质(m1和m2)能量相等,运动距离相等,就有下面的推导过程:

由以上公式可得:运动相同的距离,质量与时间的平方成正比。

看MALDI-TOF MS的峰图,横坐标标称为质荷比(质量电荷比),并等差均匀分布,结合上面的公式推导,横坐标实则是时间的平方。
看一个MALDI-TOF MS校准数据
将Mass与Time两列做个作图
由此可见Time列就是时间的平方值,开平方后得到t值

再看MALDI-TOF MS的峰图,4365有个峰即为297.34纳秒时检测器检测到正电荷离子(微生物质谱一般是正离子模式),7158有个峰即为336.44纳秒时检测器检测到正电荷离子,峰的高低表示该时间点到达检测器的电荷的量,也称电压强度,即质谱峰图的纵坐标。

另外4365是单一物质还是混合物质不清楚,是什么结构也不清楚,它仅能反馈出在297.34纳秒这个时间点检测器上有电荷。

综上所述:MALDI-TOF MS的峰图只是一个飞行时间和电压的二维图,至于检测的是什么物质,飞行时间质谱这个技术做不到,这个技术在2002年获得诺贝尔奖,火了一下,由于这个技术本身的局限性,直到微生物的应用,才真的火起来,关于微生物质谱有系列真真假假的事情(本公众号上已推出三篇,还有后续),如果您明白了原理,一些假说不攻自破。
请记住下面的话应该是正确的:
  • 已知的蛋白可以在MALDI-TOF MS上出质谱峰,如已知分子量2000的蛋白,可能在2000位置出一个峰(单电荷峰),也可能在1000位置出一个峰(双电荷峰),即MALDI-TOF MS检测的是蛋白。

  • 未知样品的MALDI-TOF MS质谱峰不一定是蛋白峰,是什么?MALDI-TOF MS这个技术做不到检测的是什么物质,它只是一个飞行时间和电压的二维图,微生物检测就是一个未知样品。

  • 已知的核酸在MALDI-TOF MS上出质谱峰就是核酸峰,即核酸检测功能。

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