PRKN基因研究进展
PRKN基因研究概况
Parkin是由PRKN基因编码而来的,该基因长达138万bp,是人类最大的基因之一,小鼠和大鼠的PRKN基因的长度也在120万bp左右。人类的Parkin蛋白由465个氨基酸构成,该蛋白是一种E3泛素连接酶,负责将死亡标签——泛素贴在无用的蛋白上,让蛋白酶识别分解。PRKN在人和大小鼠中的基因长度差别不但,但主要形式的RNA却有很大区别,人类的主要转录本的长度几乎是大鼠的2.7倍,不过蛋白的氨基酸碱基数量却是一致的。
Prkn是一种帕金森病(PD)隐性基因,也就是说需要该基因出现隐性纯合时人类才会患病。图1显示的是Parkin蛋白的不同结构和突变。从左到右分别是泛素结合区(UBL),连接区(Linker),0号环指结构域(RING0), 典型的结构RBR(RING1-IBR-RING2),其中的REP结构富含半胱氨酸。
图1. 人群中突变的位点,红色表示致病位点,黑色表示影响不明。DOI: 10.3233/JPD-160989。
在PD中,Parkin蛋白主要影响线粒体功能,钙离子稳态,突触功能,溶酶体/蛋白酶降解功能,神经炎症,蛋白折叠,凋亡以及氧化和例子损伤;该蛋白同时在肿瘤中发生中也有重要的作用,不正常的Parkin蛋白功能会导致生长增殖抑制不受控,激活持续的增值信号,造成细胞能量失调,抑制细胞死亡,影响基因组的稳定性,诱导血管生成等。
图2. Parkin在帕金森病和肿瘤中的作用。DOI: 10.1007/s12035-018-0879-1。
在正常情况下,Parkin(PARK2)能将CyclinE和其他蛋白标记上泛素,引导蛋白酶对其进行降解,而当蛋白编码基因突变导致蛋白基因异常时,将无法正常的形式泛素化的功能,从而导致一些细胞周期蛋白和其他功能性蛋白的聚集,在具备有丝分裂条件的细胞中肯能引起异常增殖,在无法有丝分裂的的神经元中引起凋亡(图3)。
图3. 引自DOI: 10.1007/s12035-018-0879-1。
PRKN基因在人体组织的表达
图4. 人和小鼠SNCA基因mRNA相对表达量。在脑组织和睾丸中该基因的表达明显高于其他组织,此外人类中心脏和肾脏也有高表达,甚至超过了该基因的传统研究组织——大脑;此外人类肾上腺中也有高于平均值的表达(表达信息为归一化的相对值,而非直接RPKM数据;同物种内部比较,小鼠和人之间无可比性)。信息来源:NCBI。