RADIOTHER ONCOL | 单细胞RNA测序分析乳腺癌肿瘤突变负荷、免疫检查点串扰和放射敏感性 (IF 5.252)
编译：刘宁，编辑：十九、江舜尧。
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韩国首尔国立大学In Ah Kim等人于2019年11月22日在医学国际权威期刊Radiotherapy and Oncology在线发表题为《Tumor mutation burden, immune checkpoint crosstalk and radiosensitivity in single-cell RNA sequencing data of breast cancer》的文章。在这项研究中，使用ScRNA-seq分析了源自乳腺癌细胞和免疫细胞的转录和突变谱，主要解答肿瘤突变负荷，免疫检查点串扰和放射敏感性之间的关系。
文章摘要：
介绍：试验使用源自乳腺癌和免疫细胞的ScRNA-seq数据分析了主要集中于肿瘤突变负荷（TMB），免疫检查点串扰和放射敏感性的转录和突变谱。
材料和方法：ScRNA-seq转录组数据是从GEO数据库（GSE75688）中获得的。放射敏感性指数（RSI）用于评估每个细胞的放射敏感性。CD274 mRNA表达用于替代PD-L1表达状态。针对免疫和肿瘤细胞组（N = 492）采用了一种以确定肿瘤和免疫细胞之间的潜在相互作用的计算方法，从原始肿瘤和转移性淋巴结（N = 317）获得肿瘤细胞的原始scRNA-seq数据，并通过比较放射敏感性（RS）和放射耐受（RR）肿瘤细胞之间的TMB和突变特征进而分析突变数据。
结果：大多数RR细胞是基础亚型，并显示较高的PD-L1阳性率。TNBC或HER2亚型患者显示出肿瘤与免疫细胞之间的配体-受体相互作用的数量增加。与管腔亚型患者相比，HER2亚型患者肿瘤细胞和T细胞之间的PD-L1配体-受体相互作用差异性增加。同时，TNBC亚型患者的CTLA-4配体-受体相互作用增加。RR细胞中的TMB显著高于RS细胞。
结论：RR细胞表现出基础亚型，具有高TMB和高PD-L1表达，在具有MSI的肿瘤中具有突变特征。肿瘤和免疫细胞之间的差异性串扰与乳腺癌的患者亚型有关。这些发现可能有助于确定潜在的生物标志物并在乳腺癌免疫检查点封锁与放射治疗中的寻找最佳组合策略。
图1 | 放射敏感性的异质性和具有PD-L1表达的肿瘤细胞的分布
图2 | RS和RR细胞之间的总体突变情况和错配修复基因突变的比较
图3 | RR和RS细胞中的突变特征和改变的途径
图4 | 根据患者亚型的差异免疫检查点相互作用