预测模型第2篇|基因表达预测模型登上血液学顶级期刊
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简介
2020年2月血液学顶级杂志 Leukemia杂志发表了我国多中心研究:基因基因表达的预测模型预测成人淋巴瘤预后。研究设计主要是先通过差异表达分析,再通过 LASSO降维。训练集,内部验证,再独立外部验证。
摘要
该研究旨在建立一个基于基因表达的分类器,以预测T细胞淋巴母细胞性淋巴瘤(T-LBL)患者的生存结果。在探究进行性(n = 22)和无进展(n = 28)T-LBL患者的整体基因表达谱后,鉴定出43种差异表达的mRNA。然后使用基于NanoString量化的LASSO Cox回归建立了基于11个基因的分类器。在训练队列中(n = 169),使用分类器进行分层的高危患者的无进展生存期显着较低(PFS:危险比4.123,95%CI 2.565-6.628;p≤0.001),无疾病生存期(DFS) :与低危患者相比,HR 3.148,95%CI 1.857-5.339;p << 0.001)和总体存活率(OS:HR 3.790,95%CI 2.237-6.423;p << 0.001)。在内部测试(n = 84)和独立的验证队列(n = 360)中验证了分类器的预后准确性。由五个独立变量(包括分类器,乳酸脱氢酶水平,ECOG-PS,中枢神经系统受累和NOTCH1 / FBXW7状态)组成的预后诺模图显示的预后准确性要比单独每个单独变量高得多。添加基于五个miRNA的签名进一步提高了该列线图的准确性。此外,列线图评分≥154.2的患者从BFM方案中明显受益。总之,该诺模图包括基于11个基因的分类器,可能有助于个人预后的预测和治疗决策。
主要图表
附上文献
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