初创公司Adela宣布商业化DNA甲基化液体活检技术，致力于多癌种早期检测和分型
近日，加拿大液体活检初创公司Adela表示正在将基于DNA甲基化的液体活检技术——甲基化cfDNA免疫沉淀和高通量测序（cfMeDIP-seq）进行商业化。这是一种检测甲基化的全基因组方法，提供了通过单一检测大规模检测多种疾病的潜力，由该公司的联合创始人兼首席科学官Daniel De Carvalho和其他研究人员共同开发。未来，该技术可能应用于癌症检测的各个领域，尤其是多癌种早期检测。
据介绍，Adela已获得cfMeDIP-seq技术的许可,（点击查看此前报道）并于近日完成了由F-Prime Capital领投的6000万美元A轮融资。该资金将支持推进cfMeDIP-seq技术的商业化，初步应用于从早期检测到疾病监测的癌症全程护理。
Adela首席医疗官Anne-Renee Hartman表示：“cfMeDIP-seq可将基因组甲基化区域与非甲基化区域区分开来，并优先针对甲基化区域进行测序。这一技术优势相信可以满足早期癌症检测筛查对高灵敏度和特异性的检测要求。”据悉 ，该方法不依赖亚硫酸氢盐转化，样本制备过程不会对DNA造成损伤，可有效地分析血液中的所有DNA甲基化片段，从单个血液样本中实现稳健的癌症检测。
除了检测早期癌症外，该技术还可以提供有关癌症组织起源甚至组织学亚型的信息。发表在Nature和Nature Medicine上的数据显示，cfMeDIP-seq技术对多种癌症检测和组织学亚型具有高灵敏度，包括肾癌和颅内脑肿瘤。这两种癌症尚无法使用其他液体活检方法在疾病早期检测到。
目前，Adela公司没有透露该检测技术性能的具体指标，并提供了来自合作者De Carvalho以及一些独立研究团队的9篇同行评审文章中的数据。数据显示，cfMeDIP-seq可以用于至少10种不同癌症类型的早期检测。2018年发表在Nature上的一项研究表明，该方法可以区分七种不同的肿瘤类型。De Carvalho领导的一项研究表明，该方法能够检测其他血液检测方法不易发现的癌症，例如脑癌和肾细胞癌，尤其是致命的癌症，例如胰腺癌。
Adela表示，在来自七种癌症类型和健康对照的189份血浆样本中，cfMeDIP-seq正确分类了171份。在对200名早期胰腺癌患者和200名健康捐赠者进行了盲法检测中，cfMeDIP-seq以94%的特异性和82%的敏感性检测到癌症。
上述数据作为该技术的研究结果发表在2018年的Nature论文中。目前，关于cfMeDIP-seq检测胰腺癌的性能是未发表的数据。此外，基于cfMeDIP-seq技术已经发表了多篇论文，进一步描述了该癌症检测平台的性能。Hartman表示，该公司目前正在计划研究以训练其分类器算法，并进行临床验证。Adela将在“不久的将来”启动这些研究并提供更多信息。
Nationwide Children's基因组医学研究所的联合执行主任、脑癌研究员Elaine Mardis表示：“这些都是较好的研究数据。但该方法仍处于研究阶段，还没有进行明确的临床试验来支持这项早期临床检测方法。如何设计试验以及需要多长时间将是重要的下一步。”
Adela进入了一个仍处于起步阶段但已被早期企业主导的市场。近期，GRAIL在其PATHFINDER 研究数据的支持下于上个月启动了Galleri癌症早期检测试验。cfMeDIP-seq检测技术与Galleri一样，也基于整个基因组的甲基化测序。液体活检公司Thrive Early Detection已在2019年完成的A轮和2020年B轮融资筹集了约3.67亿美元，正在敲定其检测设计，并与美国FDA进行谈判计划进行多站点试验。但Hartman相信，他们的检测具有一定的技术优势，使其能够改变检测、诊断和治疗疾病的方式。
目前，Adela计划最终在诊断后为患者提供检测，但重点仍是早期检测。Hartman强调：“这不是单一的癌症血液检测。虽然该公司尚不知道它能够检测到多少癌症，但我们正专注于检测高发病率和高死亡率的癌症，相信会有更多癌症可以被检测。”已有研究结果显示，cfMeDIP-seq在检测急性髓系白血病、胰腺癌、结肠直肠癌、乳腺癌、肺癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、头颈癌和颅内脑癌中有良好的应用前景。
Mardis表示：“该技术在脑癌检测方面有着令人难以置信的有趣潜力。脑癌相对罕见，预后结果往往很差。早期发现高级别脑癌可能有一定的优势，因为早期疾病的治疗可能更有效。”
一些研究结果表明，利用血液cfDNA检测脑癌突变是非常难以实现的，例如来自被诊断出脑癌患者的血液。基于甲基化阵列所做的检测研究，研究人员在许多脑癌中发现了清晰的特征模式，可以进行精确分型甚至亚型分型。
一般来说，早期发现会增加癌症成功治疗的机会，这是整个早期检测领域不断发展的驱动因素。Mardis认为：“除了成功治疗癌症的机会更高，我们还可以避免患者未来因转移性疾病住院、治疗和死亡。”同时，脑癌也很难进行活检。“这种检测方法很有前途，只是目前还没有临床益处的真实证据。通过基因组方法进行早期检测已经得到了早期与晚期癌症存活率数据的支持。”
此外，Adela公司还相信该检测技术可用于最小残留疾病监测和患者对治疗的反应，甚至肿瘤学以外的应用。Bratman表示：“cfDNA可能包含来自其他非恶性组织的信号，我们可以设想使用它来检测涉及甲基化组的不同组织器官损伤和疾病，但现在说清楚这些是什么还为时过早。”