【答疑】总分公司税号不一致如何处理业务问题
1、总分公司税号不一致如何处理业务问题
湖北“投融资总监”微信公众号粉丝：亲爱的房老师您好！武汉某一房地产总公司（简称A公司），2017年经孝感地区B县市政府招商引资，取得了两个地块的住宅开发用地，为了便于开发和管理，A总公司于2018年4月于B县设立分公司C，因当初招商对房地产开发资质要求，两个地块士地合同及产权士地使用证均办理在武汉总公司A名下，目前前两块地上均分期分批开发。
营改增之前，第一批所开发的商品房因土地权属武汉总公司，五证只能用总公司名义办理，对外开出的销售发票以C分公司名义开出，银行的按歇货款放款直接放款到武汉A公司B县设立账户上。现准备建设后期的目前正在办理《工程施工许可证》，对于新开工的项目，只能采用增值税一般计税办法，涉及土地出让金增值税抵扣的问题，后期开发尚未签订建安合同，这种涉税跨区域，由于总分公司纳税人名称不一致和各自纳税识别号不ー致，且总分公司各自独立核算，但B县市该地块仅只有分公司C在财务上独立核算，则后期对土地出让金等增值税抵扣和士地增值税清算，会因发票名称和税号不一致影响扣除的问题，（但目前政府的土地使用证也不可能分割过户到分公司的名下，也受当时地产开发资质招商条件设定的影响），存在一定税收风险，现不知用什么样的方法处理为好，恳请房老师百忙之中指点，谢谢了！
回复：
亲爱的“投融资总监”微信公众号粉丝，你反映的问题看来还是很难处理的。从企业所得税角度，总分机构可以汇总纳税，税号不一致无所谓。
但从增值税角度，因为分公司有税务登记要单独申报，涉及到发票抵扣认证等问题，税号不一致，肯定不能抵扣。
建议你们参阅一下财政部、国家税务总局《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016）36号）文件。
其中第四十六条第一项规定，经税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
根据财政部、国家税务总局局《关于重新印发＜总分机构试点纳税人増值税计算缴纳暂行办法＞的通知》（财税（2013）74号）规定，分支机构按照应征增值税銷售额和预征率计算缴纳増值税。
汇总纳税估计很难通过，但你们可以尝试一下。
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