28基因评分可预测晚期头颈癌远程转移复发

头颈癌

头颈癌是一种范围广泛的疾病，是美国第六大常见癌症。超过三分之二的接受初步治疗的头颈癌患者的恶性肿瘤已经发展到晚期，需要多模式的治疗，包括放疗和化疗。尽管治疗头颈癌的能力在过去几年中确实有所提高，但有相当一部分患者在接受初步治疗后会出现复发性疾病。详细描述高危患者的特征和了解癌症如何复发，可以推进头颈癌的治疗。

多种临床危险因素已被用于其对头颈部癌症的潜在预后价值。然而，在鉴别初始治疗失败患者的治疗抵抗机制时，这些因素的应用尚未明确界定。此外，在平行测序时代，基因风险分层的前景还有待实现。

从本质来说，癌症是一种遗传疾病。人体内的每一个细胞都是由基因编码的一系列指令控制的。突变偶尔会越过正常的安全检查，导致细胞生长和增殖失控，进而导致癌症。通过利用基因差异，我们的研究小组在纽约布朗克斯蒙特菲奥雷卫生系统和国家癌症研究所指定的阿尔伯特爱因斯坦癌症中心，开发了一个预后遗传风险评分，确定哪些患者是在疾病复发中处于最高风险。

基因组预测

基因组预测工具的开发是与一个团队合作的完成结果，该团队由Albert Einstein医学院肿瘤学研究所所长、放射肿瘤学系教授和副主任Chandan Guha博士、病理学系教授兼主任Michael B.Prystowsky、耳鼻咽喉病理学副教授Thomas Ow组成。为了评估哪些局部晚期疾病患者的风险最大，研究人员从癌症基因组图谱（Cancer Genome Atlas）中确定了病例，这是一个具有里程碑意义的癌症基因组项目，从分子层面上描述了20000多种原发性癌症，包括头颈癌。挑选24例远处转移和48例匹配的非转移对照病例，其肿瘤细胞脱离原发肿瘤，转移到身体其他部位。共有1100个基因差异表达，主要改变上皮间质重塑和在功能途径分析中细胞因子免疫的相互作用。

研究小组基于远程转移治疗失败的患者研发了一种遗传特征，并使用最小绝对收缩和选择算子回归分析来完善临床适用的28个基因预后评分。

该评分在一项内部前瞻性多部门研究中得到验证，该研究包括在Montefiore治疗的120多名患者。结果显示，高危评分患者的无远处转移生存期明显缩短（HR，9.0；95%CI，2.6-31.7；P<0.0001）。对远程转移的预测，风险评分优于肿瘤分期和淋巴结分期，多因素校正后仍有显著性差异。在因人乳头瘤病毒呈阴性的高危癌症人群中，遗传评分提高了对远程治疗失败的预测价值，而人乳头瘤病毒是不吸烟人群中患头颈癌的一个普遍原因（HR，20.8；95%CI，2.6-166；P=0.004）。

癌症样本的基因表达计算为混合细胞遗传学图谱的平均值，不仅包括癌细胞，还包括免疫细胞和支持组织。为了更好地掌握肿瘤微环境中实际的情况，研究人员应用单细胞RNA测序来粗略计算各种细胞类型比例的分布。单细胞去卷积研究结果显示，在远程转移治疗失败的患者中，肿瘤微环境中肿瘤相关成纤维细胞和T细胞亚群失调显著增加。

参考文献：

https://www.onclive.com/view/28-gene-score-may-predict-distant-metastatic-recurrence-in-advanced-head-and-neck-cancers