Nature Biotechnology | 单细胞多组学分析揭示混合表型急性白血病调控程序 (1区 IF 31.864)
编译：冬日暖阳，编辑：十九、江舜尧。
原创微文，欢迎转发转载。
美国斯坦福大学医学院William J.Greenleaf等人于2019年12月2日在国际顶级刊物NatureBiotechnology在线发表题为《Single-cell multiomic analysis identifies regulatoryprograms in mixed-phenotype acute leukemia》的文章。这项工作建立了一个实验和分析方法，通过整合多单细胞技术分析鉴定了混合表型急性白血病的调控程序。
识别人类疾病的发生的原因需要对DNA可及性、基因表达和蛋白质丰度等异常分子表型进行反卷积分析。本研究研究人员提出了一个单细胞框架，其整合了多路复用的蛋白质定量、转录组分析和染色质可及性分析。使用这一方法，William等人建立了健康血液发育的正常表观遗传基线，然后将其用于消除混合表型急性白血病患者血液中异常分子特征的卷积。尽管在患者队列中存在广泛的表观遗传异质性，但研究人员观察到了患者之间常见的恶性特征以及个体患者表型间共有的患者特异性调节特征。转录组和染色质可及性图谱的综合分析确定了91601个潜在的peak-to-gene连锁基因，以及和调控白血病特异性基因的相关转录因子，例如与CD69邻近的RUNX1连锁调控元件。这些结果表明，在正常发育的框架内对单个细胞进行综合、多组学分析可以揭示来自患者样品的疾病的独特和共享分子机制。
文章重要图片说明
图1 | 人造血的多组分表观遗传学和表型分析
图2 | MPALs在造血系统中的多组分映射来识别正常细胞和白血病细胞
图3 | scATAC-seq和scRNA-seq综合分析白血病治疗计划
赞 (0)