基因家族分析文章之windows环境下两小时基本重现

我只是有点伤感

昨天看到生信人公众号开始卖某类服务，其实我本来是没什么感觉的，毕竟只是把灰色交易摆出来，其中如何，大家清楚。我个人并不反对也不支持。然而，我居然看到了TBtools出的图，而且还在示例成果（某个文章）中。很明显，我伤感的不是这个工作没有引用TBtools，毕竟我甚至审过用了TBtools而并没有引用的；我伤感的也不是拿TBtools出的图来卖，毕竟我一直都很乐意别人愿意用TBtools；我伤感的是，TBtools出来图被卖了，还没有得到引用。我很受伤，于是我本来打算花一个小时的时间直接从零开始重现这个文章（实际用了两个小时）。具体原因是，作者挖出来这些基因的方式，似乎并不是其文章写的那么简单。
然而，聪明的我，还是不使用linux的情况下，挖出来了。

结果展示

作者写的方法是这样子的

其实最后我发现那个pfam和blast是不可能一次出来24个的，evalue也不大可能是那个阈值，所以稍微查了一个文献

既然找出来了，下一步就是什么？

先做一个基因结构，我们用什么？

TBtools啊

再做一个结构域

结构域太单调，那就两个图一起

MEME也做一个

为什么我说这个文章用了TBtools出图？

现在出的图不是这样的，是这样的

其他的，没时间玩了
休息够了，再干半个小时课题，回宿舍，
我的意思是，到这里就差不多了，已经没有继续怼这个事情的心情和时间了

参与讨论交流