这篇11.164分的 J Exp Clin Cancer Res,居然能把m6A甲基化做出一个loo...
成天在PubMed上冲浪,随便搜了一篇m6A甲基化的文献
。说实话,虽然只是11.164分的 J Exp Clin Cancer Res上的文章,但其实标题还是有点吸引人的,因为有这么一个ALKBH5-HOXA10 loop:
其实文章内容并不复杂,ALKBH5是一个m6A甲基化擦除蛋白
。在研究中表明她在上皮性卵巢癌顺铂耐药的细胞中表达上调:
于是他们就分析了ALKBH5的功能
……
接着他们发现了一个和ALKBH5高度共表达的基因HOXA10
,而HOXA10的mRNA可以结合上ALKBH5蛋白。
同样HOXA10又是ALKBH5的转录激活因子
……这就形成了这样一个Loop环状的结构:
那么既然ALKBH5对于顺铂耐药有一定的贡献
,那这个Loop环上的HOXA10是不是也对顺铂耐药有作用呢?
于是他们顺便做了一下HOXA10对于顺铂耐药的功能试验
:
那具体ALKBH5对于下游基因产生的影响是什么呢?也就是他们接下去要寻找的是ALKBH5对于顺铂耐药的机制研究,
于是他们通过ChIP Seq、甲基化Seq等等实验,来分析了ALKBH5的下游基因,在其中,发现了JAK(应该还记得JAK/STAT信号通路吧)能与ALKBH5结合……
那ALKBH5对于JAK是如何影响的呢?由于ALKBH5是m6A擦除蛋白,那么假设是维持了JAK的mRNA稳定性
,那对于JAK的mRNA上m6A敏感的蛋白就列入了考虑其机制的范畴。这个蛋白就是YTHDF2,她是负责降解mRNA的,去除m6A甲基化后,
降解被抑制……
接着,既然是Loop环上的ALKBH5-HOXA10对于顺铂耐药产生的贡献,于是他们分析了两者同时对于顺铂耐药的影响
,也就是敲除一个,过表达另一个……看看是否有表型回复:
以及ALKBH5-HOXA10对于下游JAK的影响
……
最后,
形成了这样的示意图:
只能说他们的想法是好的,但结果不严谨
……亮点是Loop,缺点是机制不完善…… 要看这篇文献,可以自己去PubMed上下搜一下。或者在评论区进行评论,就发给你们PMID号。实在不行就回复“公克”(不要在评论区回复
),要么就直接星球上见(当然,进不去也无所谓
)。好吧,今天就先给你们策到这里吧,祝你们心明
眼亮
。
封面:套环游戏 https://pic.sogou.com/
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