黑海深处有“深红色荧光”，竟是因为这些菌？！
意大利学者Cristiana Callieri等人于2019年2月28日在《The ISME Journal》上发表题目为《The mesopelagic anoxic Black Sea as an unexpected habitat for Synechococcus challenges our understanding of global “deep red fluorescence”》的文章。
该研究证实了在黑海深海区域“深红色荧光”（一种叶绿素a 荧光信号）的出现和Synechococcus spp. 的存在。此外，还验证了Synechococcus 菌株BS56D在深海中的存活能力且会积累叶绿素a，进而可能导致有“深红色荧光”的荧光信号产生。
文章摘要
黑海是世界上最大的不完全混合湖，其中90%（从100米深到1000米深）的水都是缺氧水。在深海洋水区域有被称为“深红色荧光”的荧光信号，一种叶绿素a-（Chl a）信号，还很少被了解。
在两次巡航中，我们在深度为750m的水域中反复发现每毫升水中含有多达103个海洋微型蓝细菌（picocyanobacteria），并分离出两种富含藻红蛋白的聚球藻属（Synechococcus sp.）菌株（BS55D和BS56D）。对BS56D进行检测，结果表明其具有高适应性，包括在缺氧/黑暗条件下Chl a的积累以及当再次暴露于光时其光合作用的能力。两种菌株的全基因组测序表明了基因的存在，证实了菌株可在恶劣的中胚层环境中存活的假设。
这一发现提供了新的证据，支持早期关于“深红色荧光”信号与深度缺氧海洋中存活的微生物细菌群体有关这一猜。因此，建议以后重新考虑可存活的聚球藻属在黑暗深水中的生态作用。
文中主要图片说明
图1由三个Argo浮标（模型PROVORCTS-4 NUT）测量的叶绿素a（左上）和溶解氧（右上）浓度分布。
图2 2015年在黑海西部环流（St. 307：43.17N-29.00E）两次巡航期间进行的Synechococcus spp.丰度剖面图与2016年夏季获得的新剖面图进行了比较。
图3 在实验48天期间SynechococcusBS56D在有氧/光和缺氧/黑暗条件下生长的情况。a Synechococcus的数量，b叶绿素a细胞含量，c PSII的光合活性。
图4 SynechococcusBS55D和BS56D spp. 的最大可能系统发育树与来自海洋，咸水，广盐水和淡水栖息地的新型菌株的代表的系统发育基因组学。
图5 海洋，沿海和淡水Synechococcus spp.（包括新BS55D和BS56D）中PBS基因簇的结构和相似性。PBS类型I，II，III（a-d）和IIB。PC：藻蓝蛋白; PE：藻红蛋白; AplA：Allophycoyanin样蛋白; 藻胆素裂解酶：CpeY，CpeZ，CpeF，CpeS，CpeT，CpeU，RpcG，RpcE，RpcE，RpcF，RpcT; 比林合成：pebA，pebB。
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