科研 | JAMA子刊 | 加州大学河滨分校Prue Talbot教授:三手烟可以通过刺激细胞破坏呼吸系统上皮细胞的基因表达
编译:冬日暖阳,编辑:十九、江舜尧。
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论文ID
原名:ExperimentalAcute Exposure to Thirdhand Smoke and Changes in the Human Nasal EpithelialTranscriptome: A Randomized Clinical Trial
译名:三手烟可以通过刺激细胞破坏呼吸系统上皮细胞的基因表达
期刊:JAMA NetworkOpen
发表时间:2019.6.28
通讯作者: Prue Talbot
通讯作者单位:加州大学河滨分校
DOI号:10.1001/jamanetworkopen.2019.6362
实验设计
选取4组志愿者,分成处理组和对照组,在暴露于清洁空气或THS 3小时之前和之后,收集志愿者鼻上皮细胞,进行RNA测序,并分析基因的差异表达(DEG),从而进行生物信息学分析(图1)。
结果
暴露于THS后人鼻上皮细胞基因表达表达发生改变
选取年龄27至49岁,无慢性疾病、不吸烟的4组健康女性。第一组接受清洁空气暴露,第二组接受第二次暴露;因此,研究者无法确定顺序对RNA表达的影响。在处理RNA测序读数后,分析数据以确定暴露于清洁空气(1组vs 2组)或THS(3组vs 4组)的组中的基因表达是否存在差异。当受试者暴露在干净空气中时发现的2个下调基因的绝对倍数变化分别为8.2和8.7。在暴露于清洁空气的组中,没有基因显著上调。由于这些结果表明,佩戴口罩3.5小时和吸入洁净空气对基因表达没有显著影响,因此没有对洁净空气进行进一步的研究。与暴露前相比,暴露后采集的鼻样本具有显著的DEG数,共有382个基因显著上调(FDR<0.1),7个基因下调。上调基因的对数2倍变化范围为2-7,下调基因的对数2倍变化范围为2-9。这些数据表明,在相对较短的时间内吸入THS可显著改变人类鼻上皮中的基因表达。
基因GO富集分析
试验对上调的DEGs进行GO富集分析,以确定与THS相关的生物功能。试验分析确定了11种功能在生物过程中富集,13种功能在细胞成分中富集,1种功能在分子功能中富集。所有过程均显著丰富(q <0.05)。暴露于THS的受试者的大多数受影响的生物过程和细胞成分涉及线粒体功能或RNA代谢。Top-GO生物过程术语包括核糖核蛋白复合物生物发生过程(GO:0022613)、细胞呼吸(GO:0045333)、呼吸电子传输链(GO:0022904)和线粒体ATP合成耦合电子传递过程(图2A)。剩下的大部分生物过程包括氧化磷酸化相关功能,最丰富的GO细胞成分包括线粒体蛋白复合物(GO:0098798)、线粒体膜部分(GO:0044455)、核糖体亚基(GO:0044391)、线粒体内膜(GO:0005743)(q = 7.21 × 10−6)、呼吸链(GO:0070469)、大核糖体亚基(GO:0015934),和呼吸链复合体(GO:0098803)(图2B)。在这个实验组中,没有发现下调基因的富集GO项,很可能是因为这组基因的数量很少的原因。
对THS暴露后升高的DEGs进行了进一步富集分析。这项分析产生了25条显著富集的途径。前6个途径(图2C)包括柠檬酸循环(R-HSA-1428517)、呼吸电子传递(R-HSA-611105)、翻译(R-HSA-72766)、线粒体蛋白导入(R-HSA-1268020)、mRNA剪接小途径(R-HSA-72165)和核苷酸切除修复(R-HAS-5696398)。
Pathway分析
在暴露于THS的组中,还使用上调的基因进行了pathway途径分析。确定的主要途径包括Sirtuin信号传导途径,EIF2信号传导,线粒体功能障碍和氧化磷酸化(表1)。IPA中鉴定的某些途径与使用Reactome富集分析所鉴定的那些途径重叠,包括线粒体相关的途径和DNA修复相关的途径。确定的主要毒理学途径主要包括与线粒体活性有关的过程,例如线粒体功能障碍,线粒体和线粒体膜的跨膜电位增加,以及线粒体和线粒体膜的通透性降低等。通过IPA鉴定了THS暴露后与疾病和功能的DEG相关(表2)。这些功能包括减少细胞死亡和增加细胞活力,同源重组和细胞增殖等。
图4. 概述人鼻上皮细胞对三手烟反应的示意图
结论
总而言之,这是第一个证明THS与人类基因表达之间的关联研究。结果表明,THS诱导后差异表达基因共389个,涉及细胞应激诱导的线粒体过度融合、细胞存活途径相关(图3),例如DNA修复、线粒体内膜、呼吸电子传递链、氧化应激等途径。如果不对此状态加以控制,这些基因差异表达有可能引起细胞死亡。该研究为医生治疗暴露于THS的患者以及将来制定有关治理被THS污染的室内环境的法规提供了重要的基础。
总结
本研究表明仅仅被动吸入三手烟3个小时,就可以显著改变不吸烟者鼻上皮细胞的基因表达,从而影响线粒体活动损害DNA,其造成的长期影响可能导致癌症的主要原因之一。这并不是危言耸听,虽然仅接触三手烟3个小时并不可能导致癌症,但长期暴露于三手烟环境中将对健康产生影响。二手烟、三手烟对我们的身体健康存在很大威胁,但是我们对其潜在的健康危害知之甚少。有些家庭中父母老人都在吸烟,殊不知这将对孩子(尤其是婴幼儿)造成极大的危害。尼古丁等化学物质可以吸附在衣服上面、家具、墙面上,并且长时间不会降解,不在家人朋友面前吸烟并不意味着,这就不会对他们造成伤害,也不意味着他们可以躲避伤害。通过本文的研究可以明确的告知吸烟的朋友,珍爱生命,远离烟草。
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