生信文献 | ANXA8在胃癌中的预后价值

题目:Prognostic Value of ANXA8 in Gastric Carcinoma


Gene : ANXA8

同文章【生信文献 | 在基底细胞样乳腺癌中,ANXA4通过与ANXA1相互作用激活JAK-STAT3信号通路】的ANXA4是同一家族,上一篇文章,不到3分,这篇文章做的比前面的文章简单,分稍微高点,有时候搞不懂。


首先,作者在通过实验和数据库的数据证实,ANXA8 这基因在胃癌中高表达,生信分析部分就是TCGA数据库与 GEO 数据库(GSE19826和GSE13861) ,就是一个简单的差异基因分析,可参考文章:【一文就会TCGA数据库基因表达差异分析】和【GEO数据库表达数据的提取以及limma包进行差异分析】,同时发现,ANXA8低表达有较好的生存期【参考文章:TCGA数据库:生存分析】,并做了个Western blot 。

当然,还有一个数据统计表,TCGA数据临床数据的提取参考文章:TCGA数据库:临床数据下载与整理

同时免疫组化证实,ANXA8在癌症组织中高表达。

然后进行cox回归分析,在GC患者中,ANXA8是一个独立的预后标志物。

这篇文章整体没有多少内容,但我发现作者Figure1 中TCGA数据结果图并不是按照他方法获得的,而是利用GEPIA这个在线工具做的。

(0)

相关推荐