Linux上python3的miniconda安装

step1:下载安装包

地址:https://repo.anaconda.com/miniconda/

命令:wget -c 所选安装包的具体地址

step2:安装

安装命令:  chmod 777 安装包

sh 安装包

tip:询问是否初始化Miniconda3时,选“no”

step3:验证

先输入conda命令试试,若没有成功,则需要添加环境变量至./bashrc文件中。添加的环境变量是:export  PATH="/root/miniconda3/bin:"$PATH  其中蓝色字体部分应该与你自定义的miniconda的安装路径一致。再输入conda测试。

step4:添加清华大学镜像源(这一步可能仅在下载python包的时候起效)

命令如下:

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --set show_channel_urls yes

conda config --get channels

step5:一些使用相关命令

(1)查看已有环境列表:conda env list      tip:conda版本不能太旧

(2)创建环境: conda create -n 环境名称 python=版本号

(3)激活/退出环境:conda activate 环境名称 / conda deactivate

(4)安装包:pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 包名称

(5)换回conda的默认源: conda config --remove-key channels

参考文献:Linux系统下conda的安装与使用_从青从争喽的博客-CSDN博客_linux安装conda

(0)

相关推荐

  • 国内可用Anaconda 源的镜像站及换国内源方法

    目前清华开源镜像站和中科大开源镜像站均已发出公告表示已取得Anaconda授权,不久就将重新上线Anaconda软件源(见文末图).那目前我知道的国内可用Anaconda源的镜像站就有3个,分别是清华 ...

  • 单细胞转录组10X数据处理视频课程上游流程代码

    在华为云服务器可以重现这个分析流程,16核64G内存,不考虑数据下载环节,5天即可完成文章全部分析环节. 背景自学 最先在生信技能树有过一些教程: 10X genomics单细胞数据集探索 10x的单 ...

  • conda国内源

    清华源.中科大源大部分时间能用,但没事也会被封.最近发现的北外源挺好用.推荐使用: 北外镜像(推荐): conda config --add channels https://mirrors.bfsu ...

  • 解密conda channels

    channels是conda下载包的镜像网站,通过如下命令可以查看已有的channels conda config --show channels channels:   - https://mirr ...

  • (9条消息) win10 Linux子系统WSL2+CUDA11.0+ubuntu

    文章目录 1 WIN10下安装WSL2 1.1wsl2系统安装 1.2 安装自己的一些必须项 1.3 /mnt目录下挂载的文件系统默认权限为777的问题 1.4 wsl2轻量桌面安装 2 NVIDIA ...

  • conda与bioconda解决生信软件安装困扰

    简介 conda原本是为了解决Python模块安装的依赖问题,然而可能是无心栽柳柳成荫,conda目前已经超越了其最初目的而存在,可以解决大多数软件的安装和配置,包括各种本身与python毫无关系的包 ...

  • 居然还可以这样欺骗软件

    我们的马拉松生物信息学入门课程进入到Linux实战环节,给大家都提供了一个云服务器账号,这样全部的学员都可以登录到我们的服务器里面方便沟通和交流.授课进行到conda安装和管理生物信息学软件,首先在自 ...

  • Anaconda出现CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url的解决方法

    使用anaconda创建一个新的环境,执行"conda create -n scrapyEnv python=3.6",结果出现了CondaHTTPError,下面我们就一起来了解 ...

  • 单细胞基因组拷贝数变异流程

    主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的  http://www ...

  • 宏基因组分析专题(2):生物信息学软件的应用市场-Conda的安装流程

    本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面 什么是Conda? Conda是一款可以帮助我们轻松安装几乎所有的生物信息学软件的工具,说Con ...

  • (5条消息) 百度飞浆paddlepaddle下载安装

    (5条消息) 百度飞浆paddlepaddle下载安装

  • pytorch慢到无法安装,该怎么办?

    最近几天,后台几个小伙伴问我,无论pip还是conda安装pytorch都太慢了,都是安装官方文档去做的,就是超时装不上,无法开展下一步,卡脖子的感觉太不好受. 这些小伙伴按照pytorch官档提示, ...