你距离国自然可能就差一个环状RNA
相比于miRNA,lncRNA,环状RNA的热度绝对是OK的,热是很热,问题是数据比较少,想数据挖掘特别困难,它不像miRNA,lncRNA,TCGA数据库里面可以得到,如果想挖得深入一点,必须自己来做实验了。但是简单的挖掘还是可以的,例如GEO数据库。下面我们就讲一下如何利用GEO选题。
首先,我们可以登录一下GEO 数据库,然后搜索XXXcancer circRNA 找到自己需要研究的数据(可能也没有),然后做差异分析(直接GEO2R或者下载数据用R做也可以)得到差异环状RNA
然后,就要花钱了,收集病人样本进行测序,验证是否跟GEO数据挖掘一致,如果一致,继续往下做,分析该环状RNA与病人预后的相关性,得到预后结果进行假设:该环状RNA可能抑制癌症的发展?那么是怎么抑制?做为某miRNA海绵,抑制该miRNA使其不能调控其靶基因,从而能抑制癌症的发展?
根据这些思路进行国自然课题设计,如果结果顺利,拿下国自然应该是没有什么问题。但是问题就难在需要投资做预实验,因为任何投资都是有风险的,如果预实验搞砸了,钱就白花了。搞基金肯定是不简单的,需要大量的时间和金钱投入。
最后,祝大家都能拿到自己的国自然!!!
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