做生物信息学的时候，怎么样在一堆乱码中找到自己需要的物种？
做生物信息学的时候，往往需要找到对应的物种，但是往往物种是用拉丁文写的，这是非常令人头痛的事情。例如在GO和KEGG富集分析时常常要我们选择对应的物种，如果我们的基因是人、小鼠、大鼠，这就好办了，可能大家一眼就看出了，如果是其他动物，或者是植物，大家就懵逼了。因此，这里总结了大量的物种供大家参考。
|
Ateles geoffroyi 蜘蛛猴 |
age |
|
Human lymphocryptovirus 伊波病毒 |
ebv |
|
Gorilla gorilla 大猩猩 |
ggo |
|
Human cytomegalovirus 人类巨细胞病毒 |
hcmv |
|
Human immunodeficency virus 1 人类艾滋病毒 |
hiv1 |
|
Homo sapiens 人 |
hsa |
|
Human rhadinovirus 人类卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒 |
kshv |
|
Lemur catta 环尾狐猴 |
lca |
|
Lagothrix lagotricha 绒毛猴 |
lla |
|
Macaca mulatta 猕猴 |
mml |
|
Macaca nemestrina 豚尾猕猴 |
mne |
|
Pygathrix bieti 黑腿白臀叶猴 |
pbi |
|
Pan paniscus 侏儒黑猩猩 |
ppa |
|
Pongo pygmaeus 婆罗州猩猩 |
ppy |
|
Pan troglodytes 黑猩猩 |
ptr |
|
Rhesus lymphocryptovirus 恒河猴淋巴隐伏病毒属 |
rlcv |
|
Rhesus monkey rhadinovirus 恒河猴疱疹病毒 |
rrv |
|
Symphalangus syndactylus 合趾猿 |
ssy |
|
Mouse gammaherpesvirus 68 – |
mghv |
|
Mus musculus 小鼠 |
mmu |
|
Rattus norvegicus 大鼠 |
rno |
|
Caenorhabditis briggsae秀丽隐杆线虫 |
cbr |
|
Caenorhabditis elegans 秀丽小杆线虫 |
cel |
|
Drosophila ananassae 果蝇 |
dan |
|
Drosophila erecta 果蝇 |
der |
|
Drosophila grimshawi 果蝇 |
dgr ­ |
|
Drosophila melanogaster 黑腹果蝇 |
dme |
|
Drosophila mojavensis 果蝇 |
dmo |
|
Drosophila persimilis 果蝇 |
dpe |
|
Drosophila pseudoobscura 拟暗果蝇 |
dps |
|
Danio rerio 斑马鱼 |
dre |
|
Drosophila sechellia 果蝇 |
dse |
|
Drosophila simulans 果蝇 |
dsi |
|
Drosophila virilis 果蝇 |
dvi |
|
Drosophila willistoni 果蝇 |
dwi |
|
Drosophila yakuba 果蝇 |
dya |
|
Xenopus laevis 非洲爪蟾 |
xla |
|
Xenopus tropicalis 热带爪蟾 |
xtr |
|
Arabidopsis thaliana 阿拉伯芥 |
ath |
|
Brassica oleracea 芥蓝菜 |
bol |
|
Brassica rapa 油菜 |
bra |
|
Oryza sativa 水稻 |
osa |
|
Populus trichocarpa 三角叶杨 |
ptc |
|
Solanum lycopersicum 西红柿 |
sly |
|
Vitis vinifera 葡萄 |
vvi |
|
Anopheles gambiae 蚊子 |
aga |
|
Apis mellifera 蜜蜂 |
ame |
|
Branchiostoma floridae 佛罗里达文昌鱼 |
bfl |
|
Bombyx mori 蚕 |
bmo |
|
Bos taurus 牛 |
bta |
|
Capitella sp. I 淡水小头虫 |
cap |
|
Canis familiaris 狗 |
cfa |
|
Cricetulus griseus 中国仓鼠 |
cgr |
|
Ciona intestinalis – |
cin |
|
Ciona savignyi 海鞘 |
csa |
|
Takifugu rubripes 日本虎河豚 |
fru |
|
Gallus gallus 鸡 |
gga |
|
Lottia gigantea 霸王莲花青螺 |
lgi |
|
Locusta migratoria 东亚飞蝗 |
lmi |
|
Monodelphis domestica 短尾负鼠 |
mdo |
|
Mardivirus gallid herpesvirus2 type 1 (禽类)马立克氏病病毒 |
mdv1 |
|
Mardivirus gallid herpesvirus2 type 2 (禽类)马立克氏病病毒 |
mdv2 |
|
Macaca mulatta 猕猴 |
mml |
|
Ornithorhynchus anatinus 鸭嘴兽 |
oan |
|
Ovis aries 绵羊 |
oar |
|
Oikopleura dioica 异体住囊虫 |
odi |
|
Saccoglossus kowalevskii 囊舌虫 |
sko |
|
Saguinus labiatus 白唇獠狨 |
sla |
|
Schmidtea mediterranea 真涡虫 |
sme |
|
Strongylocentrotus purpuratus 紫海胆 |
spu |
|
Sus scrofa 野猪 |
ssc |
|
Tribolium castaneum 拟谷盗 |
tca |
|
Tetraodon nigroviridis 斑点绿河豚 |
tni |
|
Brassica napus 欧洲油菜 |
bna |
|
Carica papaya 木瓜 |
cpa |
|
Chlamydomonas reinhardtii 绿藻 |
cre |
|
Dictyostelium discoideum 黏菌 |
ddi |
|
Gossypium herbecium 草棉 |
ghb |
|
Gossypium hirsutum 棉花 |
ghr |
|
Glycine max 黄豆 |
gma |
|
Gossypium rammindii – |
gra |
|
Medicago truncatula 蒺藜苜蓿 |
mtr |
|
Physcomitrella patens 苔藓 |
ppt |
|
Pinus Taeda 火炬松 |
pta |
|
Sorghum bicolor 高粱,蜀黍 |
sbi |
|
Solanum lycopersicum 西红柿 |
sly |
|
Selaginella Moellendorffii 地衣类 |
smo |
|
Saccharum officinarum 甘蔗 |
sof |
|
Triticum aestivum 小麦 |
tae |
|
Zea mays 玉米 |
zma |
希望本文对大家有所帮助。
SCI狂人团队