忽必烈与幼弟阿里不哥在蒙古龙兴之地的漠北大战
漠北地区是蒙古帝国的发祥地，是蒙古帝国的龙兴之所。从窝阔台汗以来就是蒙古国的政治经济文化中心。随着统治地区的不断扩大，尤其是忽必烈十来年的经营，漠南汉地的政治经济文化地位在不断上升。
漠北
由于阿里不哥占据漠北和林，忽必烈被迫在开平称汗，但没有漠北地区和中道诸王的支持，不仅是不合法的，而且很难长久统治下去。因此，战胜阿里不哥，争取漠北诸王及其部民，就成为忽必烈巩固其统治地位的当务之急。
自从阿里不哥称汗以来，忽必烈借助漠南地区人力物力的支持，采取了一系列应急措施：中统元年（1260）五月，“以阿里不哥反，诏赦天下”。
同时，诏立十路宣慰司，以加强对漠南地区的控制。同月又“诏平阳、京兆两路宣抚司签兵七千人，于延安等处守隘，以万户郑鼎、昔剌忙古带领之，贫不能应役者，官为资给”。
征诸路兵3万驻扎燕京附近，命诸路买马1万余匹供应上都开平。六月诏燕京、西京、北京三路宣抚司运米10万石，运往开平及抚州、沙井等地以备军需。同月，命令东平路万户严忠济等发精兵15000人开赴开平；不久，又诏十路宣抚司造战袄、裘衣、帽子，各以万计，运往开平。七月，命令燕京、北京、西京、真定、平阳、大名、东平、益都等路宣抚司，制造羊裘、皮袄、靴子等，皆以万计，运往开平。
那年七月，忽必烈决定亲征阿里不哥，将战略的重点放在和林。兀良合台、塔察儿等蒙古名将、东道诸王均率部参战，并成为此次战争的主力。不久，又命亳州张柔、归德邸浃、睢州王文干、水军解诚和张荣宝、东平严忠嗣、济南张宏等汉军七万户，率领部众随征阿里不哥。此时忽必烈用于进攻漠北和防守幽燕的军队，估计有十五万左右。
蒙古军队
蒙古帝国的首都哈刺和林的饮食，通常是用大车从汉地运来的。忽必烈合罕封锁了运输，那里便开始了大饥荒，物价飞涨。漠北的物资供应是由漠南汉地提供的，蒙古草原上人口膨胀得太快，仅仅依靠草原的畜牧业已经无法生存下去了，尽管官府鼓励外来百姓去和林周边耕种土地，但事实证明那里不适合农业生产，如果不能从汉地源源不断地运来粮食等日常生活用品，和林就要面临饥荒的威胁。
在此南北争战之际，忽必烈不得不下令切断对漠北的物资供给。再加上1250—1270年间，蒙古草原遭受了低温灾害天气，使蒙古这种生态脆弱的地区出现牲畜大减的局面，于是蒙古地区便发生了大饥荒，物价飞涨，无法支持一场持久的战争。
为了摆脱困境，阿里不哥说：“最好是让早就担任宫廷职务、通晓各种事情、法度、规矩的察合台的儿子拜答儿的儿子阿鲁忽去掌管自己祖父的首邑和他的兀鲁思，以便把武器和粮食送来援助我们，并守卫质浑河边境，使旭烈兀的军队和别儿哥的军队不能从那方面前来援助忽必烈。”
阿鲁忽本来没有继位的资格，阿里不哥的这一决定对他来说自然是求之不得的。因此，“阿鲁忽像离弦的箭般地飞走了，他着手安排自己的事。当他到达可失合耳边境时，他已聚集了大约十五万骑勇士。他开始作乱，进行对抗”。
察合台世系表
这时，惊魂未定的阿里不哥，带着瘦弱饥饿的军队驻扎在谦谦州边境（乌斯）河附近，由于害怕忽必烈合罕前来攻打他，他派遣急使去请求宽恕”，实际上是派使者向忽必烈假投降，说：“我们这些弟弟们有罪，他们是出于无知而犯罪的，你是我的兄长，可以对此加以审判，无论你吩咐我到什么地方去，我都会去，决不违背兄长的命令，我养壮了牲畜就来见你，别儿哥、旭烈兀和阿鲁忽也将前来，我正在等待他们的到来。”
当使者向忽必烈传达了这些话后，忽必烈低声细语地说：“浪子们现在回头了，清醒过来、聪明起来、回心转意了，他们承认自己的过错了。”又说：“旭烈兀、别儿哥和阿鲁忽到那里时，让他们立即派急使来，他们的急使一到，我们就可以确定一下应当在何处聚会，首先应当让他们守信用，如果你们在他们到达之前就来，那更好。”
忽必烈
忽必烈要求使者把这些话带给阿里不哥，自己则在今蒙古国翁金河一带度过冬天后，返回了开平。留下十万大军让宗王也松格率领驻扎和林，“等阿里不哥到达时，同他一起前来”。
这时，旭烈兀和阿鲁忽都倾向于忽必烈汗方面，两人不断互相派遣急使。旭烈兀甚至“向阿里不哥派去急使，责备他并力图制止他的称汗之举，他向忽必烈汗也派去了急使。
同样，阿鲁忽也向忽必烈派去了急使，当他得知海都和忽秃忽在阿里不哥方面后，便数次攻打他们，把他们赶走”。而钦察汗国的可汗别儿哥则“向忽必烈和阿里不哥双方都派去使者，劝他们和解”。
四大汗国
以上记载反映了当时的四大汗国对忽必烈、阿里不哥之争的态度：其中伊儿汗国的可汗旭烈兀、察合台汗国的可汗阿鲁忽明显倾向于忽必烈方面。钦察汗国的可汗别儿哥则不愿直接介入双方的矛盾，只是向双方都派去使者，劝他们和解。
只有被分为六个王国的窝阔台后王中的海都和忽秃忽站在阿里不哥一边。为了争取这几大汗国的支持，忽必烈采取了一系列重大措施：一是直接派人告知旭烈兀和阿鲁忽：将波斯地区正式封给旭烈兀作为他的汗国，将阿姆河到西辽的大部分国土封给阿鲁忽作为察合台汗国的领土，争取他们对自己的支持，并且明确表示不会对其汗国的内政进行干涉，保持他们汗国的独立性，忽必烈的这一旨意，应该看做是允许各个汗国独立发展的开端。
二是千方百计地对诸王贵族进行赏赐。蒙古国的赏赐政策由来已久，尤其是新的大汗即位之初，往往要倾国库所有赏赐支持自己的诸王贵族。
忽必烈即位时，和林的国库在阿里不哥的掌控之下，他自己所能掌握的只有开平府和燕京万亿库的财富，根本不足以赏赐诸王功臣。为此他重用王文统和阿合马等人，实行纸币制度和财政、税收政策的改革，在不太长的时间内积累了大量财富，这才为忽必烈进行长期的战争和赏赐诸王功臣创造了条件。于是忽必烈颁布了一个赏赐诸王贵族的名单，将大批银两、财物赏给了宗王、后妃和立有军功的大将、重臣，其中包括一直支持自己的塔察儿、木哥、也松格、拔绰以及合丹等宗王，也包括旭烈兀、别儿哥、阿鲁忽等几大汗国的可汗，甚至连反对自己的海都，忽必烈也按汗国可汗的标准给予了大量赏赐，这一做法大得人心，对于瓦解阿里不哥的联盟起到了重大作用。
阿里不哥
但是，已经走投无路的阿里不哥并不打算放弃争夺汗位的斗争，他一方面假意和谈，麻痹忽必烈，另一方面又努力征集财赋和兵马，积极扩军备战。
在第二年（1261）秋天，等马匹喂养肥壮之后，他便背弃承诺，再次派兵攻打忽必烈。但这次进攻却不是堂堂正正，而是偷偷摸摸，当他的军队接近驻扎在边境上的忽必烈的军队时，他派出急使说：“我是来投降的。”从而麻痹了守卫和林的也松格，然后发动突然袭击，将也松格的军队打败，重新占领了和林，然后穿越草原，直趋忽必烈的首都开平。
忽必烈急忙调集塔察儿的军队和汉地7万户张柔、王文干、张荣实、严忠嗣和张宏等人的部队随驾征伐阿里不哥。那年11月，双方军队在昔木土脑儿决战。在这次战役中，宗王合丹等人带领军队斩杀阿里不哥的将领合丹火儿赤及其士兵3000多人，塔察儿和合必赤分别率军奋勇杀敌，大败敌军，并且追击了50多里，阿里不哥的队伍血流成河。阿里不哥大败，向北逃窜，忽必烈说道：“不要去追他们，他们都是些不懂事的孩子，应当使他们明白过来，后悔自己的行为。”
10天后，阿里不哥和阿速台听说忽必烈的军队已经退回去了，再次商议回师对忽必烈开战，忽必烈击溃了阿里不哥的右翼，而他的左翼则一直抵抗到黑夜。夜里，双方都带着军队回到各自的营地，损失都很大。冬天，双方各自返回本土，并且在那里度过了春天与夏天。这就是漠北的兄弟战争，之后可是讲一下忽必烈和阿里不哥在中原的战争。