Plant Physiol |华中农大叶志彪团队利用全基因组关联分析西红柿27个农艺性状的遗传结构的研究中取得新进展

番茄（solanum lycopersicum）是一种很有价值的果树，产量是番茄最重要的农艺性状之一。然而，番茄产量相关性状的遗传结构尚未完全阐明。基于∼从605份不同材料中获得440万个单核苷酸多态性，我们对番茄27个农艺性状进行了全基因组关联研究。共鉴定出239个与129个基因座相对应的显著关联，其中包含许多先前报道的和与营养和生殖发育相关的额外基因，这些基因座解释了平均∼表型变异的8.8%。

在番茄驯化改良过程中，共筛选出51个与25个性状相关的基因座。此外，编码铝激活苹果酸转运体的候选基因Sl激活苹果酸转运体15在功能上被鉴定为叶片气孔形成的关键调节因子，从而影响光合作用和抗旱性。本研究为番茄遗传研究和育种提供了有价值的信息。

Tomato (Solanum lycopersicum) is a highly valuable fruit crop, and yield is one of the most important agronomic traits. However, the genetic architecture underlying tomato yield-related traits has not been fully addressed. Based on ∼4.4 million single nucleotide polymorphisms obtained from 605 diverse accessions, we performed a comprehensive genome-wide association study for 27 agronomic traits in tomato. A total of 239 significant associations corresponding to 129 loci, harboring many previously reported and additional genes related to vegetative and reproductive development, were identified, and these loci explained an average of ∼8.8% of the phenotypic variance. A total of 51 loci associated with 25 traits have been under selection during tomato domestication and improvement. Furthermore, a candidate gene, Sl-ACTIVATED MALATE TRANSPORTER15, that encodes an aluminum-activated malate transporter was functionally characterized and shown to act as a pivotal regulator of leaf stomata formation, thereby affecting photosynthesis and drought resistance. This study provides valuable information for tomato genetic research and breeding.

导师简介：

叶志彪   博士、教授、博士生导师

华中农业大学园艺林学学院副院长，园艺植物生物学教育部重点实验室副主任，国家现代农业产业技术体系大宗蔬菜（分子育种）岗位科学家，中国园艺学会常务理事、湖北省园艺学会副理事长、中国园艺学会番茄分会副会长。1990.09—1992.05赴英国诺丁汉大学进行植物生物技术合作研究，2001.02—2004.09赴美国康奈尔大学进行植物分子生物学合作研究。1995年获农业部有突出贡献的中青年专家称号，1996年享受国务院政府特殊津贴；国家863计划先进个人；入选教育部骨干教师计划；获得湖北省科技进步一等奖、二等奖3次，农业部科技进步二等奖1次；2010年“全省科普工作先进工作者”称号。主要从事蔬菜育种和分子生物学教学和科研工作，先后主持国家863计划、国家973项目课题，国家自然科学基金、省（部）级科研项目、国际合作项目等50项。

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